Protein–RNA interactions for Protein: B9EJ80

Pdzd8, PDZ domain-containing protein 8, mousemouse

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Length 1,147 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzd8B9EJ80 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Pdzd8B9EJ80 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Pdzd8B9EJ80 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Pdzd8B9EJ80 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Pdzd8B9EJ80 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Pdzd8B9EJ80 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Pdzd8B9EJ80 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Pdzd8B9EJ80 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Pdzd8B9EJ80 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Pdzd8B9EJ80 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Pdzd8B9EJ80 Rgp1-202ENSMUST00000107886 5888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Pdzd8B9EJ80 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Pdzd8B9EJ80 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Pdzd8B9EJ80 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Pdzd8B9EJ80 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
Pdzd8B9EJ80 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Pdzd8B9EJ80 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Pdzd8B9EJ80 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Pdzd8B9EJ80 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Pdzd8B9EJ80 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Pdzd8B9EJ80 Adamts16-201ENSMUST00000080145 4981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Pdzd8B9EJ80 Setd1a-202ENSMUST00000047157 5927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Pdzd8B9EJ80 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Pdzd8B9EJ80 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Pdzd8B9EJ80 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Pdzd8B9EJ80 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Pdzd8B9EJ80 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Pdzd8B9EJ80 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Pdzd8B9EJ80 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Pdzd8B9EJ80 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Pdzd8B9EJ80 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Pdzd8B9EJ80 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Pdzd8B9EJ80 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Pdzd8B9EJ80 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Pdzd8B9EJ80 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Pdzd8B9EJ80 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Pdzd8B9EJ80 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Pdzd8B9EJ80 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Pdzd8B9EJ80 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Pdzd8B9EJ80 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Pdzd8B9EJ80 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Pdzd8B9EJ80 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Pdzd8B9EJ80 Phf24-201ENSMUST00000069184 6392 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Pdzd8B9EJ80 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Pdzd8B9EJ80 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Pdzd8B9EJ80 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Pdzd8B9EJ80 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Pdzd8B9EJ80 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Pdzd8B9EJ80 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Pdzd8B9EJ80 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Pdzd8B9EJ80 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Pdzd8B9EJ80 Fuca2-203ENSMUST00000121465 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Pdzd8B9EJ80 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Pdzd8B9EJ80 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Pdzd8B9EJ80 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Pdzd8B9EJ80 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Pdzd8B9EJ80 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Pdzd8B9EJ80 Nup205-204ENSMUST00000201374 6411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Pdzd8B9EJ80 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Pdzd8B9EJ80 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Pdzd8B9EJ80 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Pdzd8B9EJ80 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Pdzd8B9EJ80 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Pdzd8B9EJ80 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Pdzd8B9EJ80 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Pdzd8B9EJ80 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Pdzd8B9EJ80 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Pdzd8B9EJ80 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Pdzd8B9EJ80 Nfatc2-204ENSMUST00000109184 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Pdzd8B9EJ80 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Pdzd8B9EJ80 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Pdzd8B9EJ80 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
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Pdzd8B9EJ80 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Pdzd8B9EJ80 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Pdzd8B9EJ80 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Pdzd8B9EJ80 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Pdzd8B9EJ80 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Pdzd8B9EJ80 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Pdzd8B9EJ80 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Pdzd8B9EJ80 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Pdzd8B9EJ80 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Pdzd8B9EJ80 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Pdzd8B9EJ80 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Pdzd8B9EJ80 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Pdzd8B9EJ80 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Pdzd8B9EJ80 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Pdzd8B9EJ80 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Pdzd8B9EJ80 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Pdzd8B9EJ80 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Pdzd8B9EJ80 Iqsec3-203ENSMUST00000151397 8067 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Pdzd8B9EJ80 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Pdzd8B9EJ80 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Pdzd8B9EJ80 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Pdzd8B9EJ80 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Pdzd8B9EJ80 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Pdzd8B9EJ80 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Pdzd8B9EJ80 Armc8-201ENSMUST00000035043 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Pdzd8B9EJ80 Shank2-203ENSMUST00000105902 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
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