Protein–RNA interactions for Protein: B2RW38

Cfap58, Cilia- and flagella-associated protein 58, mousemouse

Predictions only

Length 873 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cfap58B2RW38 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cfap58B2RW38 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cfap58B2RW38 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cfap58B2RW38 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cfap58B2RW38 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Cfap58B2RW38 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Cfap58B2RW38 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cfap58B2RW38 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cfap58B2RW38 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cfap58B2RW38 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cfap58B2RW38 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cfap58B2RW38 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cfap58B2RW38 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cfap58B2RW38 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cfap58B2RW38 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cfap58B2RW38 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cfap58B2RW38 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cfap58B2RW38 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cfap58B2RW38 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cfap58B2RW38 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cfap58B2RW38 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cfap58B2RW38 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cfap58B2RW38 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cfap58B2RW38 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cfap58B2RW38 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cfap58B2RW38 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cfap58B2RW38 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cfap58B2RW38 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cfap58B2RW38 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cfap58B2RW38 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cfap58B2RW38 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cfap58B2RW38 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cfap58B2RW38 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cfap58B2RW38 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cfap58B2RW38 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cfap58B2RW38 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cfap58B2RW38 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cfap58B2RW38 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cfap58B2RW38 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cfap58B2RW38 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cfap58B2RW38 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cfap58B2RW38 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Cfap58B2RW38 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Cfap58B2RW38 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cfap58B2RW38 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cfap58B2RW38 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cfap58B2RW38 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cfap58B2RW38 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Cfap58B2RW38 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Cfap58B2RW38 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cfap58B2RW38 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cfap58B2RW38 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cfap58B2RW38 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cfap58B2RW38 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Cfap58B2RW38 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cfap58B2RW38 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cfap58B2RW38 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cfap58B2RW38 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cfap58B2RW38 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cfap58B2RW38 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cfap58B2RW38 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cfap58B2RW38 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cfap58B2RW38 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cfap58B2RW38 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cfap58B2RW38 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cfap58B2RW38 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cfap58B2RW38 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cfap58B2RW38 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cfap58B2RW38 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cfap58B2RW38 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cfap58B2RW38 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cfap58B2RW38 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cfap58B2RW38 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cfap58B2RW38 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cfap58B2RW38 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cfap58B2RW38 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cfap58B2RW38 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Cfap58B2RW38 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Cfap58B2RW38 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Cfap58B2RW38 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cfap58B2RW38 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cfap58B2RW38 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cfap58B2RW38 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cfap58B2RW38 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cfap58B2RW38 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cfap58B2RW38 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cfap58B2RW38 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cfap58B2RW38 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cfap58B2RW38 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cfap58B2RW38 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cfap58B2RW38 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cfap58B2RW38 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cfap58B2RW38 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cfap58B2RW38 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cfap58B2RW38 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cfap58B2RW38 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cfap58B2RW38 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cfap58B2RW38 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cfap58B2RW38 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Cfap58B2RW38 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.8 ms