Protein–RNA interactions for Protein: B2RV77

Gm5483, MCG130182, isoform CRA_a, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5483B2RV77 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm5483B2RV77 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm5483B2RV77 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm5483B2RV77 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm5483B2RV77 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm5483B2RV77 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm5483B2RV77 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm5483B2RV77 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm5483B2RV77 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm5483B2RV77 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm5483B2RV77 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm5483B2RV77 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm5483B2RV77 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm5483B2RV77 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm5483B2RV77 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm5483B2RV77 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm5483B2RV77 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm5483B2RV77 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm5483B2RV77 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm5483B2RV77 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm5483B2RV77 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm5483B2RV77 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm5483B2RV77 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm5483B2RV77 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm5483B2RV77 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm5483B2RV77 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm5483B2RV77 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm5483B2RV77 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm5483B2RV77 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm5483B2RV77 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm5483B2RV77 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm5483B2RV77 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm5483B2RV77 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm5483B2RV77 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm5483B2RV77 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm5483B2RV77 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm5483B2RV77 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm5483B2RV77 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm5483B2RV77 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm5483B2RV77 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm5483B2RV77 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm5483B2RV77 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm5483B2RV77 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm5483B2RV77 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm5483B2RV77 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm5483B2RV77 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm5483B2RV77 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm5483B2RV77 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm5483B2RV77 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm5483B2RV77 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm5483B2RV77 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm5483B2RV77 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm5483B2RV77 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm5483B2RV77 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm5483B2RV77 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm5483B2RV77 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm5483B2RV77 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm5483B2RV77 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm5483B2RV77 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm5483B2RV77 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm5483B2RV77 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm5483B2RV77 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm5483B2RV77 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm5483B2RV77 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm5483B2RV77 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm5483B2RV77 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm5483B2RV77 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm5483B2RV77 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm5483B2RV77 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm5483B2RV77 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm5483B2RV77 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm5483B2RV77 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm5483B2RV77 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm5483B2RV77 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm5483B2RV77 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm5483B2RV77 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm5483B2RV77 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm5483B2RV77 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm5483B2RV77 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm5483B2RV77 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm5483B2RV77 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm5483B2RV77 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm5483B2RV77 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm5483B2RV77 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm5483B2RV77 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm5483B2RV77 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm5483B2RV77 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm5483B2RV77 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm5483B2RV77 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm5483B2RV77 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm5483B2RV77 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm5483B2RV77 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm5483B2RV77 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm5483B2RV77 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm5483B2RV77 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm5483B2RV77 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm5483B2RV77 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm5483B2RV77 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm5483B2RV77 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm5483B2RV77 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.7 ms