Protein–RNA interactions for Protein: B2RUS7

Abcc8, ATP-binding cassette, sub-family C (CFTR/MRP), member 8, mousemouse

Predictions only

Length 1,588 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcc8B2RUS7 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Abcc8B2RUS7 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Abcc8B2RUS7 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Abcc8B2RUS7 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Abcc8B2RUS7 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Abcc8B2RUS7 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Abcc8B2RUS7 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Abcc8B2RUS7 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Abcc8B2RUS7 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Abcc8B2RUS7 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Abcc8B2RUS7 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Abcc8B2RUS7 Tas2r137-201ENSMUST00000064932 1073 ntAPPRIS P1 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Abcc8B2RUS7 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Abcc8B2RUS7 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Abcc8B2RUS7 Psme2b-201ENSMUST00000104958 837 ntAPPRIS P1 BASIC28.7■■■□□ 2.18
Abcc8B2RUS7 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Abcc8B2RUS7 Rpl3-ps1-201ENSMUST00000120557 1210 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
Abcc8B2RUS7 4933406I18Rik-201ENSMUST00000124673 905 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Abcc8B2RUS7 Dnd1-ps-201ENSMUST00000196992 964 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
Abcc8B2RUS7 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Abcc8B2RUS7 Tpd52l1-205ENSMUST00000215515 857 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
Abcc8B2RUS7 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
Abcc8B2RUS7 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Abcc8B2RUS7 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Abcc8B2RUS7 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Abcc8B2RUS7 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Abcc8B2RUS7 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Abcc8B2RUS7 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
Abcc8B2RUS7 6330418K02Rik-201ENSMUST00000124298 743 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Abcc8B2RUS7 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Abcc8B2RUS7 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Abcc8B2RUS7 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Abcc8B2RUS7 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Abcc8B2RUS7 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Abcc8B2RUS7 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Abcc8B2RUS7 Gm12843-201ENSMUST00000137607 601 ntTSL 3 BASIC28.68■■■□□ 2.18
Abcc8B2RUS7 Lsmem2-201ENSMUST00000191791 369 ntTSL 3 BASIC28.68■■■□□ 2.18
Abcc8B2RUS7 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Abcc8B2RUS7 Gm45880-201ENSMUST00000213041 853 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
Abcc8B2RUS7 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Abcc8B2RUS7 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Abcc8B2RUS7 Taldo1-204ENSMUST00000211654 1362 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
Abcc8B2RUS7 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Abcc8B2RUS7 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Abcc8B2RUS7 Lsm2-207ENSMUST00000173004 870 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Abcc8B2RUS7 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Abcc8B2RUS7 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Abcc8B2RUS7 C87198-201ENSMUST00000173553 1045 ntTSL 3 BASIC28.67■■■□□ 2.18
Abcc8B2RUS7 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
Abcc8B2RUS7 Comt-201ENSMUST00000000335 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Abcc8B2RUS7 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Abcc8B2RUS7 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Abcc8B2RUS7 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
Abcc8B2RUS7 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Abcc8B2RUS7 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Abcc8B2RUS7 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Abcc8B2RUS7 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Abcc8B2RUS7 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
Abcc8B2RUS7 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
Abcc8B2RUS7 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
Abcc8B2RUS7 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Abcc8B2RUS7 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Abcc8B2RUS7 Gm11791-201ENSMUST00000139327 336 ntTSL 3 BASIC28.66■■■□□ 2.18
Abcc8B2RUS7 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Abcc8B2RUS7 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Abcc8B2RUS7 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Abcc8B2RUS7 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC28.65■■■□□ 2.18
Abcc8B2RUS7 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
Abcc8B2RUS7 Armc2-208ENSMUST00000162405 1135 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Abcc8B2RUS7 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
Abcc8B2RUS7 Cts7-204ENSMUST00000225321 1257 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
Abcc8B2RUS7 St13-201ENSMUST00000023039 1089 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
Abcc8B2RUS7 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Abcc8B2RUS7 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
Abcc8B2RUS7 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC28.65■■■□□ 2.18
Abcc8B2RUS7 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
Abcc8B2RUS7 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Abcc8B2RUS7 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
Abcc8B2RUS7 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
Abcc8B2RUS7 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Abcc8B2RUS7 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Abcc8B2RUS7 Tmod4-202ENSMUST00000107227 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
Abcc8B2RUS7 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Abcc8B2RUS7 Gm45692-201ENSMUST00000131138 557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
Abcc8B2RUS7 Tmbim6-206ENSMUST00000161250 1148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
Abcc8B2RUS7 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC28.64■■■□□ 2.18
Abcc8B2RUS7 Wfdc1-202ENSMUST00000212901 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Abcc8B2RUS7 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.17
Abcc8B2RUS7 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
Abcc8B2RUS7 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
Abcc8B2RUS7 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC28.64■■■□□ 2.17
Abcc8B2RUS7 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
Abcc8B2RUS7 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
Abcc8B2RUS7 Hoxb5os-202ENSMUST00000150698 596 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Abcc8B2RUS7 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Abcc8B2RUS7 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Abcc8B2RUS7 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Abcc8B2RUS7 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Abcc8B2RUS7 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
Abcc8B2RUS7 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms