Protein–RNA interactions for Protein: B2RUM3

AU015836, AU015836 protein, mousemouse

Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AU015836B2RUM3 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
AU015836B2RUM3 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
AU015836B2RUM3 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
AU015836B2RUM3 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
AU015836B2RUM3 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
AU015836B2RUM3 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
AU015836B2RUM3 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
AU015836B2RUM3 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
AU015836B2RUM3 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
AU015836B2RUM3 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
AU015836B2RUM3 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
AU015836B2RUM3 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
AU015836B2RUM3 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
AU015836B2RUM3 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
AU015836B2RUM3 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
AU015836B2RUM3 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
AU015836B2RUM3 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
AU015836B2RUM3 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
AU015836B2RUM3 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
AU015836B2RUM3 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
AU015836B2RUM3 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
AU015836B2RUM3 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
AU015836B2RUM3 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
AU015836B2RUM3 Hnf1b-201ENSMUST00000021016 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
AU015836B2RUM3 Arhgef2-229ENSMUST00000177303 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
AU015836B2RUM3 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
AU015836B2RUM3 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
AU015836B2RUM3 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
AU015836B2RUM3 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
AU015836B2RUM3 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
AU015836B2RUM3 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
AU015836B2RUM3 Ablim2-209ENSMUST00000129347 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
AU015836B2RUM3 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
AU015836B2RUM3 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
AU015836B2RUM3 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
AU015836B2RUM3 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
AU015836B2RUM3 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
AU015836B2RUM3 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
AU015836B2RUM3 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
AU015836B2RUM3 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
AU015836B2RUM3 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
AU015836B2RUM3 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
AU015836B2RUM3 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
AU015836B2RUM3 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
AU015836B2RUM3 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
AU015836B2RUM3 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
AU015836B2RUM3 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
AU015836B2RUM3 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
AU015836B2RUM3 A530020G20Rik-202ENSMUST00000181070 3660 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
AU015836B2RUM3 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
AU015836B2RUM3 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
AU015836B2RUM3 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
AU015836B2RUM3 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
AU015836B2RUM3 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
AU015836B2RUM3 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
AU015836B2RUM3 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
AU015836B2RUM3 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
AU015836B2RUM3 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
AU015836B2RUM3 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
AU015836B2RUM3 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
AU015836B2RUM3 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
AU015836B2RUM3 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
AU015836B2RUM3 Xylb-201ENSMUST00000039610 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
AU015836B2RUM3 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
AU015836B2RUM3 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
AU015836B2RUM3 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
AU015836B2RUM3 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
AU015836B2RUM3 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
AU015836B2RUM3 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
AU015836B2RUM3 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
AU015836B2RUM3 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
AU015836B2RUM3 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
AU015836B2RUM3 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
AU015836B2RUM3 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
AU015836B2RUM3 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
AU015836B2RUM3 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
AU015836B2RUM3 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
AU015836B2RUM3 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
AU015836B2RUM3 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
AU015836B2RUM3 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
AU015836B2RUM3 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
AU015836B2RUM3 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
AU015836B2RUM3 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
AU015836B2RUM3 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
AU015836B2RUM3 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
AU015836B2RUM3 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
AU015836B2RUM3 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
AU015836B2RUM3 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
AU015836B2RUM3 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
AU015836B2RUM3 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
AU015836B2RUM3 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
AU015836B2RUM3 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
AU015836B2RUM3 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
AU015836B2RUM3 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
AU015836B2RUM3 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
AU015836B2RUM3 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
AU015836B2RUM3 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
AU015836B2RUM3 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
AU015836B2RUM3 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
AU015836B2RUM3 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42 ms