Protein–RNA interactions for Protein: B2RU40

Prrt4, Proline-rich transmembrane protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 902 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrt4B2RU40 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Prrt4B2RU40 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Prrt4B2RU40 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Prrt4B2RU40 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Prrt4B2RU40 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Prrt4B2RU40 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Prrt4B2RU40 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Prrt4B2RU40 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Prrt4B2RU40 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Prrt4B2RU40 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Prrt4B2RU40 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Prrt4B2RU40 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Prrt4B2RU40 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Prrt4B2RU40 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Prrt4B2RU40 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Prrt4B2RU40 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Prrt4B2RU40 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Prrt4B2RU40 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Prrt4B2RU40 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Prrt4B2RU40 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Prrt4B2RU40 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Prrt4B2RU40 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Prrt4B2RU40 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Prrt4B2RU40 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Prrt4B2RU40 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Prrt4B2RU40 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Prrt4B2RU40 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Prrt4B2RU40 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Prrt4B2RU40 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Prrt4B2RU40 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Prrt4B2RU40 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Prrt4B2RU40 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Prrt4B2RU40 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Prrt4B2RU40 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Prrt4B2RU40 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Prrt4B2RU40 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Prrt4B2RU40 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Prrt4B2RU40 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Prrt4B2RU40 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Prrt4B2RU40 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Prrt4B2RU40 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Prrt4B2RU40 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Prrt4B2RU40 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Prrt4B2RU40 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Prrt4B2RU40 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Prrt4B2RU40 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Prrt4B2RU40 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Prrt4B2RU40 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Prrt4B2RU40 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Prrt4B2RU40 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Prrt4B2RU40 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Prrt4B2RU40 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Prrt4B2RU40 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Prrt4B2RU40 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Prrt4B2RU40 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Prrt4B2RU40 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Prrt4B2RU40 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Prrt4B2RU40 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Prrt4B2RU40 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Prrt4B2RU40 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Prrt4B2RU40 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Prrt4B2RU40 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Prrt4B2RU40 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Prrt4B2RU40 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Prrt4B2RU40 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Prrt4B2RU40 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
Prrt4B2RU40 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
Prrt4B2RU40 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Prrt4B2RU40 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Prrt4B2RU40 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Prrt4B2RU40 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Prrt4B2RU40 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
Prrt4B2RU40 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Prrt4B2RU40 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Prrt4B2RU40 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Prrt4B2RU40 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Prrt4B2RU40 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Prrt4B2RU40 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Prrt4B2RU40 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Prrt4B2RU40 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Prrt4B2RU40 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Prrt4B2RU40 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Prrt4B2RU40 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
Prrt4B2RU40 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Prrt4B2RU40 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
Prrt4B2RU40 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Prrt4B2RU40 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Prrt4B2RU40 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Prrt4B2RU40 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Prrt4B2RU40 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Prrt4B2RU40 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Prrt4B2RU40 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Prrt4B2RU40 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Prrt4B2RU40 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Prrt4B2RU40 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Prrt4B2RU40 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Prrt4B2RU40 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Prrt4B2RU40 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Prrt4B2RU40 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Prrt4B2RU40 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms