Protein–RNA interactions for Protein: B2RS91

Rrn3, RNA polymerase I-specific transcription initiation factor RRN3, mousemouse

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Length 656 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrn3B2RS91 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rrn3B2RS91 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Rrn3B2RS91 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Rrn3B2RS91 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rrn3B2RS91 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Rrn3B2RS91 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rrn3B2RS91 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rrn3B2RS91 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Rrn3B2RS91 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rrn3B2RS91 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rrn3B2RS91 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rrn3B2RS91 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rrn3B2RS91 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rrn3B2RS91 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rrn3B2RS91 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rrn3B2RS91 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rrn3B2RS91 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rrn3B2RS91 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rrn3B2RS91 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rrn3B2RS91 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rrn3B2RS91 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Rrn3B2RS91 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Rrn3B2RS91 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rrn3B2RS91 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rrn3B2RS91 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rrn3B2RS91 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rrn3B2RS91 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rrn3B2RS91 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rrn3B2RS91 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rrn3B2RS91 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rrn3B2RS91 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rrn3B2RS91 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rrn3B2RS91 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rrn3B2RS91 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rrn3B2RS91 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rrn3B2RS91 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Rrn3B2RS91 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rrn3B2RS91 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rrn3B2RS91 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Rrn3B2RS91 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Rrn3B2RS91 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Rrn3B2RS91 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rrn3B2RS91 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rrn3B2RS91 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rrn3B2RS91 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rrn3B2RS91 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rrn3B2RS91 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rrn3B2RS91 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rrn3B2RS91 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rrn3B2RS91 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rrn3B2RS91 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rrn3B2RS91 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rrn3B2RS91 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rrn3B2RS91 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rrn3B2RS91 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rrn3B2RS91 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rrn3B2RS91 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rrn3B2RS91 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rrn3B2RS91 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rrn3B2RS91 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rrn3B2RS91 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rrn3B2RS91 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rrn3B2RS91 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rrn3B2RS91 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rrn3B2RS91 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rrn3B2RS91 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rrn3B2RS91 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rrn3B2RS91 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rrn3B2RS91 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rrn3B2RS91 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rrn3B2RS91 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rrn3B2RS91 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rrn3B2RS91 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Rrn3B2RS91 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rrn3B2RS91 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rrn3B2RS91 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rrn3B2RS91 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rrn3B2RS91 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rrn3B2RS91 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Rrn3B2RS91 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rrn3B2RS91 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rrn3B2RS91 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rrn3B2RS91 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rrn3B2RS91 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rrn3B2RS91 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rrn3B2RS91 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rrn3B2RS91 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rrn3B2RS91 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Rrn3B2RS91 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rrn3B2RS91 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rrn3B2RS91 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Rrn3B2RS91 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rrn3B2RS91 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rrn3B2RS91 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rrn3B2RS91 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rrn3B2RS91 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rrn3B2RS91 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rrn3B2RS91 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Rrn3B2RS91 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rrn3B2RS91 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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