Protein–RNA interactions for Protein: B2RRD7

Brpf1, Peregrin, mousemouse

Predictions only

Length 1,212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brpf1B2RRD7 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Brpf1B2RRD7 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Brpf1B2RRD7 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Brpf1B2RRD7 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Brpf1B2RRD7 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Brpf1B2RRD7 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Brpf1B2RRD7 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Brpf1B2RRD7 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Brpf1B2RRD7 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Brpf1B2RRD7 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Brpf1B2RRD7 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Brpf1B2RRD7 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Brpf1B2RRD7 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Brpf1B2RRD7 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Brpf1B2RRD7 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Brpf1B2RRD7 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Brpf1B2RRD7 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Brpf1B2RRD7 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Brpf1B2RRD7 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Brpf1B2RRD7 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Brpf1B2RRD7 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Brpf1B2RRD7 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Brpf1B2RRD7 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Brpf1B2RRD7 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Brpf1B2RRD7 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Brpf1B2RRD7 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Brpf1B2RRD7 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Brpf1B2RRD7 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Brpf1B2RRD7 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Brpf1B2RRD7 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Brpf1B2RRD7 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Brpf1B2RRD7 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Brpf1B2RRD7 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Brpf1B2RRD7 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Brpf1B2RRD7 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Brpf1B2RRD7 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Brpf1B2RRD7 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Brpf1B2RRD7 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Brpf1B2RRD7 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Brpf1B2RRD7 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Brpf1B2RRD7 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Brpf1B2RRD7 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Brpf1B2RRD7 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Brpf1B2RRD7 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Brpf1B2RRD7 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Brpf1B2RRD7 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Brpf1B2RRD7 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Brpf1B2RRD7 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Brpf1B2RRD7 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Brpf1B2RRD7 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Brpf1B2RRD7 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Brpf1B2RRD7 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Brpf1B2RRD7 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Brpf1B2RRD7 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Brpf1B2RRD7 Hmgb1-202ENSMUST00000093196 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Brpf1B2RRD7 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Brpf1B2RRD7 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Brpf1B2RRD7 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Brpf1B2RRD7 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Brpf1B2RRD7 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Brpf1B2RRD7 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Brpf1B2RRD7 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Brpf1B2RRD7 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Brpf1B2RRD7 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Brpf1B2RRD7 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Brpf1B2RRD7 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Brpf1B2RRD7 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Brpf1B2RRD7 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Brpf1B2RRD7 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Brpf1B2RRD7 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Brpf1B2RRD7 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Brpf1B2RRD7 Gm22065-201ENSMUST00000103753 110 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Brpf1B2RRD7 Gm22066-201ENSMUST00000103761 110 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Brpf1B2RRD7 Gm24932-201ENSMUST00000103763 110 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Brpf1B2RRD7 Gm24115-201ENSMUST00000103799 110 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Brpf1B2RRD7 Gm22190-201ENSMUST00000103827 110 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Brpf1B2RRD7 Gm22191-201ENSMUST00000103831 110 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Brpf1B2RRD7 Gm24721-201ENSMUST00000103849 110 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Brpf1B2RRD7 Gm28018-201ENSMUST00000103869 110 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Brpf1B2RRD7 Gm26399-201ENSMUST00000103937 110 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Brpf1B2RRD7 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Brpf1B2RRD7 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Brpf1B2RRD7 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Brpf1B2RRD7 Gm25349-201ENSMUST00000177728 110 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Brpf1B2RRD7 Gm23616-201ENSMUST00000177797 110 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Brpf1B2RRD7 Gm25871-201ENSMUST00000177816 110 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Brpf1B2RRD7 Gm24752-201ENSMUST00000178240 110 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Brpf1B2RRD7 Gm24496-201ENSMUST00000178287 110 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Brpf1B2RRD7 Gm25649-201ENSMUST00000178476 110 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Brpf1B2RRD7 Gm25548-201ENSMUST00000178681 110 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Brpf1B2RRD7 Gm23147-201ENSMUST00000178841 110 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Brpf1B2RRD7 Gm26095-201ENSMUST00000179270 110 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Brpf1B2RRD7 Gm22171-201ENSMUST00000179283 110 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Brpf1B2RRD7 Gm23936-201ENSMUST00000179354 110 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Brpf1B2RRD7 Gm22619-201ENSMUST00000179516 110 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Brpf1B2RRD7 Gm25255-201ENSMUST00000179579 110 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Brpf1B2RRD7 Gm24755-201ENSMUST00000179691 110 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Brpf1B2RRD7 Gm26506-201ENSMUST00000179692 110 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Brpf1B2RRD7 Gm25086-201ENSMUST00000179931 110 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Brpf1B2RRD7 Gm23243-201ENSMUST00000180047 110 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.9 ms