Protein–RNA interactions for Protein: B2KF50

Uhrf1bp1, UHRF1 (ICBP90)-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,429 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uhrf1bp1B2KF50 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Uhrf1bp1B2KF50 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Uhrf1bp1B2KF50 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Uhrf1bp1B2KF50 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Uhrf1bp1B2KF50 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Uhrf1bp1B2KF50 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Uhrf1bp1B2KF50 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Uhrf1bp1B2KF50 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Uhrf1bp1B2KF50 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Uhrf1bp1B2KF50 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Uhrf1bp1B2KF50 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Uhrf1bp1B2KF50 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Uhrf1bp1B2KF50 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Uhrf1bp1B2KF50 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Uhrf1bp1B2KF50 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Uhrf1bp1B2KF50 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Uhrf1bp1B2KF50 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Uhrf1bp1B2KF50 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Uhrf1bp1B2KF50 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Uhrf1bp1B2KF50 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Uhrf1bp1B2KF50 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Uhrf1bp1B2KF50 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Uhrf1bp1B2KF50 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Uhrf1bp1B2KF50 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Uhrf1bp1B2KF50 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Uhrf1bp1B2KF50 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Uhrf1bp1B2KF50 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Uhrf1bp1B2KF50 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Uhrf1bp1B2KF50 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Uhrf1bp1B2KF50 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Uhrf1bp1B2KF50 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Uhrf1bp1B2KF50 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Uhrf1bp1B2KF50 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Uhrf1bp1B2KF50 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Uhrf1bp1B2KF50 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Uhrf1bp1B2KF50 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Uhrf1bp1B2KF50 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Uhrf1bp1B2KF50 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Uhrf1bp1B2KF50 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Uhrf1bp1B2KF50 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Uhrf1bp1B2KF50 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Uhrf1bp1B2KF50 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Uhrf1bp1B2KF50 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Uhrf1bp1B2KF50 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Uhrf1bp1B2KF50 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Uhrf1bp1B2KF50 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Uhrf1bp1B2KF50 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Uhrf1bp1B2KF50 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Uhrf1bp1B2KF50 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Uhrf1bp1B2KF50 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Uhrf1bp1B2KF50 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Uhrf1bp1B2KF50 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Uhrf1bp1B2KF50 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Uhrf1bp1B2KF50 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Uhrf1bp1B2KF50 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Uhrf1bp1B2KF50 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Uhrf1bp1B2KF50 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Uhrf1bp1B2KF50 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Uhrf1bp1B2KF50 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Uhrf1bp1B2KF50 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Uhrf1bp1B2KF50 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Uhrf1bp1B2KF50 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Uhrf1bp1B2KF50 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Uhrf1bp1B2KF50 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Uhrf1bp1B2KF50 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Uhrf1bp1B2KF50 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Uhrf1bp1B2KF50 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Uhrf1bp1B2KF50 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Uhrf1bp1B2KF50 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Uhrf1bp1B2KF50 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Uhrf1bp1B2KF50 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Uhrf1bp1B2KF50 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Uhrf1bp1B2KF50 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Uhrf1bp1B2KF50 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Uhrf1bp1B2KF50 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Uhrf1bp1B2KF50 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Uhrf1bp1B2KF50 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Uhrf1bp1B2KF50 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Uhrf1bp1B2KF50 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Uhrf1bp1B2KF50 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Uhrf1bp1B2KF50 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Uhrf1bp1B2KF50 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Uhrf1bp1B2KF50 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Uhrf1bp1B2KF50 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Uhrf1bp1B2KF50 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Uhrf1bp1B2KF50 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Uhrf1bp1B2KF50 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Uhrf1bp1B2KF50 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Uhrf1bp1B2KF50 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Uhrf1bp1B2KF50 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Uhrf1bp1B2KF50 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Uhrf1bp1B2KF50 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Uhrf1bp1B2KF50 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Uhrf1bp1B2KF50 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Uhrf1bp1B2KF50 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Uhrf1bp1B2KF50 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Uhrf1bp1B2KF50 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Uhrf1bp1B2KF50 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Uhrf1bp1B2KF50 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Uhrf1bp1B2KF50 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms