Protein–RNA interactions for Protein: B2KF05

Brpf3, Bromodomain and PHD finger-containing, 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brpf3B2KF05 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Brpf3B2KF05 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Brpf3B2KF05 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Brpf3B2KF05 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Brpf3B2KF05 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Brpf3B2KF05 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Brpf3B2KF05 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Brpf3B2KF05 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Brpf3B2KF05 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Brpf3B2KF05 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Brpf3B2KF05 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Brpf3B2KF05 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Brpf3B2KF05 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Brpf3B2KF05 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Brpf3B2KF05 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Brpf3B2KF05 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Brpf3B2KF05 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Brpf3B2KF05 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Brpf3B2KF05 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Brpf3B2KF05 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Brpf3B2KF05 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Brpf3B2KF05 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Brpf3B2KF05 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Brpf3B2KF05 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Brpf3B2KF05 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Brpf3B2KF05 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Brpf3B2KF05 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Brpf3B2KF05 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Brpf3B2KF05 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Brpf3B2KF05 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Brpf3B2KF05 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Brpf3B2KF05 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Brpf3B2KF05 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Brpf3B2KF05 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Brpf3B2KF05 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Brpf3B2KF05 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Brpf3B2KF05 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Brpf3B2KF05 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Brpf3B2KF05 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Brpf3B2KF05 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Brpf3B2KF05 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Brpf3B2KF05 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Brpf3B2KF05 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Brpf3B2KF05 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Brpf3B2KF05 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Brpf3B2KF05 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Brpf3B2KF05 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Brpf3B2KF05 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Brpf3B2KF05 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Brpf3B2KF05 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Brpf3B2KF05 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Brpf3B2KF05 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Brpf3B2KF05 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Brpf3B2KF05 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Brpf3B2KF05 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Brpf3B2KF05 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Brpf3B2KF05 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Brpf3B2KF05 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Brpf3B2KF05 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Brpf3B2KF05 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Brpf3B2KF05 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Brpf3B2KF05 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Brpf3B2KF05 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Brpf3B2KF05 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Brpf3B2KF05 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Brpf3B2KF05 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Brpf3B2KF05 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Brpf3B2KF05 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Brpf3B2KF05 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Brpf3B2KF05 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Brpf3B2KF05 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Brpf3B2KF05 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Brpf3B2KF05 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Brpf3B2KF05 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Brpf3B2KF05 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Brpf3B2KF05 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Brpf3B2KF05 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Brpf3B2KF05 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Brpf3B2KF05 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Brpf3B2KF05 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Brpf3B2KF05 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Brpf3B2KF05 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Brpf3B2KF05 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Brpf3B2KF05 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Brpf3B2KF05 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Brpf3B2KF05 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Brpf3B2KF05 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Brpf3B2KF05 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Brpf3B2KF05 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Brpf3B2KF05 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Brpf3B2KF05 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Brpf3B2KF05 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Brpf3B2KF05 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Brpf3B2KF05 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Brpf3B2KF05 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Brpf3B2KF05 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Brpf3B2KF05 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Brpf3B2KF05 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Brpf3B2KF05 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Brpf3B2KF05 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.4 ms