Protein–RNA interactions for Protein: B1AVU6

Gm436, Predicted gene 436, mousemouse

Predictions only

Length 407 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm436B1AVU6 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm436B1AVU6 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm436B1AVU6 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm436B1AVU6 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm436B1AVU6 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm436B1AVU6 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm436B1AVU6 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm436B1AVU6 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm436B1AVU6 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm436B1AVU6 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm436B1AVU6 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm436B1AVU6 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm436B1AVU6 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm436B1AVU6 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm436B1AVU6 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm436B1AVU6 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm436B1AVU6 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm436B1AVU6 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm436B1AVU6 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm436B1AVU6 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm436B1AVU6 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm436B1AVU6 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm436B1AVU6 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm436B1AVU6 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm436B1AVU6 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm436B1AVU6 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm436B1AVU6 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm436B1AVU6 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm436B1AVU6 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm436B1AVU6 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm436B1AVU6 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm436B1AVU6 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm436B1AVU6 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm436B1AVU6 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm436B1AVU6 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm436B1AVU6 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm436B1AVU6 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm436B1AVU6 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm436B1AVU6 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm436B1AVU6 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm436B1AVU6 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm436B1AVU6 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm436B1AVU6 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm436B1AVU6 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm436B1AVU6 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm436B1AVU6 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm436B1AVU6 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm436B1AVU6 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm436B1AVU6 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm436B1AVU6 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm436B1AVU6 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm436B1AVU6 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm436B1AVU6 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm436B1AVU6 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm436B1AVU6 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm436B1AVU6 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm436B1AVU6 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm436B1AVU6 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm436B1AVU6 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm436B1AVU6 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm436B1AVU6 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm436B1AVU6 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm436B1AVU6 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm436B1AVU6 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Gm436B1AVU6 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm436B1AVU6 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm436B1AVU6 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
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Gm436B1AVU6 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm436B1AVU6 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm436B1AVU6 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm436B1AVU6 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm436B1AVU6 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Gm436B1AVU6 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm436B1AVU6 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm436B1AVU6 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm436B1AVU6 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC13□□□□□ -0.33
Gm436B1AVU6 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Gm436B1AVU6 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm436B1AVU6 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm436B1AVU6 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Gm436B1AVU6 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm436B1AVU6 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Gm436B1AVU6 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm436B1AVU6 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Gm436B1AVU6 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm436B1AVU6 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Gm436B1AVU6 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm436B1AVU6 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm436B1AVU6 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm436B1AVU6 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Gm436B1AVU6 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm436B1AVU6 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Gm436B1AVU6 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Gm436B1AVU6 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm436B1AVU6 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm436B1AVU6 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm436B1AVU6 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
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