Protein–RNA interactions for Protein: A7XV07

Skint8, Selection and upkeep of intraepithelial T-cells protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 398 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skint8A7XV07 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Skint8A7XV07 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Skint8A7XV07 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Skint8A7XV07 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Skint8A7XV07 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Skint8A7XV07 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Skint8A7XV07 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Skint8A7XV07 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Skint8A7XV07 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Skint8A7XV07 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Skint8A7XV07 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Skint8A7XV07 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Skint8A7XV07 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Skint8A7XV07 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Skint8A7XV07 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Skint8A7XV07 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Skint8A7XV07 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Skint8A7XV07 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Skint8A7XV07 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Skint8A7XV07 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Skint8A7XV07 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Skint8A7XV07 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Skint8A7XV07 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Skint8A7XV07 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Skint8A7XV07 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Skint8A7XV07 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Skint8A7XV07 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Skint8A7XV07 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Skint8A7XV07 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Skint8A7XV07 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Skint8A7XV07 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Skint8A7XV07 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Skint8A7XV07 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Skint8A7XV07 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Skint8A7XV07 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Skint8A7XV07 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Skint8A7XV07 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Skint8A7XV07 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Skint8A7XV07 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Skint8A7XV07 Mir1938-201ENSMUST00000158746 100 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Skint8A7XV07 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Skint8A7XV07 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Skint8A7XV07 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Skint8A7XV07 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Skint8A7XV07 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Skint8A7XV07 Gm43630-201ENSMUST00000201550 776 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Skint8A7XV07 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Skint8A7XV07 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Skint8A7XV07 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Skint8A7XV07 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Skint8A7XV07 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Skint8A7XV07 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Skint8A7XV07 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Skint8A7XV07 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Skint8A7XV07 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Skint8A7XV07 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Skint8A7XV07 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Skint8A7XV07 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Skint8A7XV07 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Skint8A7XV07 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Skint8A7XV07 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Skint8A7XV07 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Skint8A7XV07 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Skint8A7XV07 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Skint8A7XV07 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Skint8A7XV07 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Skint8A7XV07 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Skint8A7XV07 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Skint8A7XV07 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Skint8A7XV07 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Skint8A7XV07 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Skint8A7XV07 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Skint8A7XV07 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Skint8A7XV07 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Skint8A7XV07 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Skint8A7XV07 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Skint8A7XV07 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Skint8A7XV07 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Skint8A7XV07 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Skint8A7XV07 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Skint8A7XV07 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Skint8A7XV07 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Skint8A7XV07 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Skint8A7XV07 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Skint8A7XV07 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Skint8A7XV07 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Skint8A7XV07 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Skint8A7XV07 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Skint8A7XV07 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Skint8A7XV07 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Skint8A7XV07 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Skint8A7XV07 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Skint8A7XV07 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Skint8A7XV07 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Skint8A7XV07 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Skint8A7XV07 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Skint8A7XV07 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Skint8A7XV07 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Skint8A7XV07 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Skint8A7XV07 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms