Protein–RNA interactions for Protein: A3KGV1

Odf2, Outer dense fiber protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 830 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Odf2A3KGV1 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Odf2A3KGV1 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Odf2A3KGV1 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Odf2A3KGV1 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Odf2A3KGV1 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Odf2A3KGV1 Asxl1-201ENSMUST00000109790 6968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Odf2A3KGV1 Ahdc1-204ENSMUST00000105916 6602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Odf2A3KGV1 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Odf2A3KGV1 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Odf2A3KGV1 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Odf2A3KGV1 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Odf2A3KGV1 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Odf2A3KGV1 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Odf2A3KGV1 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Odf2A3KGV1 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Odf2A3KGV1 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Odf2A3KGV1 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Odf2A3KGV1 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Odf2A3KGV1 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Odf2A3KGV1 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Odf2A3KGV1 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Odf2A3KGV1 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Odf2A3KGV1 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Odf2A3KGV1 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Odf2A3KGV1 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Odf2A3KGV1 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Odf2A3KGV1 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Odf2A3KGV1 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Odf2A3KGV1 Caprin1-201ENSMUST00000028607 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Odf2A3KGV1 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Odf2A3KGV1 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Odf2A3KGV1 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Odf2A3KGV1 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Odf2A3KGV1 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Odf2A3KGV1 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Odf2A3KGV1 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Odf2A3KGV1 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Odf2A3KGV1 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Odf2A3KGV1 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Odf2A3KGV1 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Odf2A3KGV1 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Odf2A3KGV1 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Odf2A3KGV1 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Odf2A3KGV1 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Odf2A3KGV1 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Odf2A3KGV1 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Odf2A3KGV1 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Odf2A3KGV1 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Odf2A3KGV1 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Odf2A3KGV1 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Odf2A3KGV1 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Odf2A3KGV1 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Odf2A3KGV1 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Odf2A3KGV1 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Odf2A3KGV1 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Odf2A3KGV1 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Odf2A3KGV1 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Odf2A3KGV1 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Odf2A3KGV1 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Odf2A3KGV1 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Odf2A3KGV1 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Odf2A3KGV1 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Odf2A3KGV1 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Odf2A3KGV1 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Odf2A3KGV1 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Odf2A3KGV1 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Odf2A3KGV1 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Odf2A3KGV1 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Odf2A3KGV1 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Odf2A3KGV1 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Odf2A3KGV1 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Odf2A3KGV1 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Odf2A3KGV1 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Odf2A3KGV1 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Odf2A3KGV1 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Odf2A3KGV1 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Odf2A3KGV1 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Odf2A3KGV1 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Odf2A3KGV1 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Odf2A3KGV1 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Odf2A3KGV1 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Odf2A3KGV1 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Odf2A3KGV1 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Odf2A3KGV1 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Odf2A3KGV1 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Odf2A3KGV1 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Odf2A3KGV1 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Odf2A3KGV1 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Odf2A3KGV1 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Odf2A3KGV1 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Odf2A3KGV1 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Odf2A3KGV1 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Odf2A3KGV1 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Odf2A3KGV1 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Odf2A3KGV1 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Odf2A3KGV1 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Odf2A3KGV1 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Odf2A3KGV1 Slc22a15-201ENSMUST00000106928 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Odf2A3KGV1 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Odf2A3KGV1 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.8 ms