Protein–RNA interactions for Protein: A2BFR3

H2al1j, Histone H2A, mousemouse

Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2al1jA2BFR3 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
H2al1jA2BFR3 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
H2al1jA2BFR3 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
H2al1jA2BFR3 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
H2al1jA2BFR3 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
H2al1jA2BFR3 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
H2al1jA2BFR3 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
H2al1jA2BFR3 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
H2al1jA2BFR3 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
H2al1jA2BFR3 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
H2al1jA2BFR3 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
H2al1jA2BFR3 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC11.43□□□□□ -0.58
H2al1jA2BFR3 Rab3c-202ENSMUST00000223922 2398 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
H2al1jA2BFR3 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
H2al1jA2BFR3 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
H2al1jA2BFR3 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
H2al1jA2BFR3 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
H2al1jA2BFR3 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
H2al1jA2BFR3 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
H2al1jA2BFR3 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
H2al1jA2BFR3 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
H2al1jA2BFR3 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
H2al1jA2BFR3 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
H2al1jA2BFR3 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
H2al1jA2BFR3 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
H2al1jA2BFR3 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
H2al1jA2BFR3 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
H2al1jA2BFR3 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
H2al1jA2BFR3 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
H2al1jA2BFR3 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC11.43□□□□□ -0.58
H2al1jA2BFR3 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
H2al1jA2BFR3 Pitpnb-204ENSMUST00000200298 2632 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
H2al1jA2BFR3 Dmtn-208ENSMUST00000228009 2643 ntAPPRIS P2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
H2al1jA2BFR3 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
H2al1jA2BFR3 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
H2al1jA2BFR3 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
H2al1jA2BFR3 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
H2al1jA2BFR3 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
H2al1jA2BFR3 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
H2al1jA2BFR3 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
H2al1jA2BFR3 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
H2al1jA2BFR3 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
H2al1jA2BFR3 Limd2-201ENSMUST00000045923 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
H2al1jA2BFR3 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
H2al1jA2BFR3 Map6-201ENSMUST00000068973 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
H2al1jA2BFR3 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
H2al1jA2BFR3 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
H2al1jA2BFR3 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC11.42□□□□□ -0.58
H2al1jA2BFR3 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
H2al1jA2BFR3 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC11.42□□□□□ -0.58
H2al1jA2BFR3 Tfb2m-201ENSMUST00000027769 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
H2al1jA2BFR3 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
H2al1jA2BFR3 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
H2al1jA2BFR3 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC11.42□□□□□ -0.58
H2al1jA2BFR3 Serpinh1-203ENSMUST00000207849 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
H2al1jA2BFR3 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
H2al1jA2BFR3 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
H2al1jA2BFR3 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
H2al1jA2BFR3 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
H2al1jA2BFR3 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
H2al1jA2BFR3 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
H2al1jA2BFR3 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
H2al1jA2BFR3 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
H2al1jA2BFR3 Rec8-201ENSMUST00000002395 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
H2al1jA2BFR3 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
H2al1jA2BFR3 Dmp1-201ENSMUST00000066708 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
H2al1jA2BFR3 Tepsin-202ENSMUST00000093901 2770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
H2al1jA2BFR3 Kcnn1-204ENSMUST00000212086 2964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
H2al1jA2BFR3 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
H2al1jA2BFR3 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
H2al1jA2BFR3 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
H2al1jA2BFR3 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
H2al1jA2BFR3 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
H2al1jA2BFR3 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
H2al1jA2BFR3 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
H2al1jA2BFR3 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
H2al1jA2BFR3 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
H2al1jA2BFR3 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
H2al1jA2BFR3 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
H2al1jA2BFR3 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
H2al1jA2BFR3 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC11.41□□□□□ -0.58
H2al1jA2BFR3 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC11.41□□□□□ -0.58
H2al1jA2BFR3 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
H2al1jA2BFR3 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
H2al1jA2BFR3 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
H2al1jA2BFR3 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
H2al1jA2BFR3 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
H2al1jA2BFR3 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
H2al1jA2BFR3 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
H2al1jA2BFR3 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
H2al1jA2BFR3 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
H2al1jA2BFR3 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
H2al1jA2BFR3 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
H2al1jA2BFR3 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
H2al1jA2BFR3 Gm4755-201ENSMUST00000181803 2647 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
H2al1jA2BFR3 Ibsp-201ENSMUST00000031246 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
H2al1jA2BFR3 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
H2al1jA2BFR3 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
H2al1jA2BFR3 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
H2al1jA2BFR3 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.2 ms