Protein–RNA interactions for Protein: A2BED8

Samt1, Predicted gene 10057, mousemouse

Predictions only

Length 237 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samt1A2BED8 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Samt1A2BED8 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Samt1A2BED8 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Samt1A2BED8 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Samt1A2BED8 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Samt1A2BED8 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Samt1A2BED8 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Samt1A2BED8 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Samt1A2BED8 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Samt1A2BED8 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Samt1A2BED8 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Samt1A2BED8 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Samt1A2BED8 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Samt1A2BED8 Pde1c-209ENSMUST00000203372 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Samt1A2BED8 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Samt1A2BED8 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Samt1A2BED8 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Samt1A2BED8 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Samt1A2BED8 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Samt1A2BED8 A730062M13Rik-201ENSMUST00000192843 1910 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Samt1A2BED8 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Samt1A2BED8 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Samt1A2BED8 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Samt1A2BED8 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Samt1A2BED8 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Samt1A2BED8 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Samt1A2BED8 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Samt1A2BED8 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Samt1A2BED8 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Samt1A2BED8 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Samt1A2BED8 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Samt1A2BED8 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Samt1A2BED8 Crybg2-213ENSMUST00000227683 5578 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Samt1A2BED8 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Samt1A2BED8 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Samt1A2BED8 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Samt1A2BED8 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Samt1A2BED8 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Samt1A2BED8 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Samt1A2BED8 Magi1-206ENSMUST00000203688 4969 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Samt1A2BED8 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Samt1A2BED8 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Samt1A2BED8 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Samt1A2BED8 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Samt1A2BED8 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Samt1A2BED8 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Samt1A2BED8 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Samt1A2BED8 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Samt1A2BED8 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Samt1A2BED8 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Samt1A2BED8 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Samt1A2BED8 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Samt1A2BED8 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Samt1A2BED8 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Samt1A2BED8 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Samt1A2BED8 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Samt1A2BED8 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Samt1A2BED8 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Samt1A2BED8 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Samt1A2BED8 Paox-201ENSMUST00000026537 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Samt1A2BED8 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Samt1A2BED8 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Samt1A2BED8 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Samt1A2BED8 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Samt1A2BED8 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Samt1A2BED8 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Samt1A2BED8 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Samt1A2BED8 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Samt1A2BED8 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Samt1A2BED8 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Samt1A2BED8 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Samt1A2BED8 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC11.9□□□□□ -0.51
Samt1A2BED8 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Samt1A2BED8 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Samt1A2BED8 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Samt1A2BED8 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Samt1A2BED8 Caprin1-201ENSMUST00000028607 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Samt1A2BED8 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Samt1A2BED8 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Samt1A2BED8 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Samt1A2BED8 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Samt1A2BED8 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Samt1A2BED8 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Samt1A2BED8 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Samt1A2BED8 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Samt1A2BED8 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Samt1A2BED8 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Samt1A2BED8 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Samt1A2BED8 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Samt1A2BED8 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Samt1A2BED8 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Samt1A2BED8 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Samt1A2BED8 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Samt1A2BED8 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Samt1A2BED8 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Samt1A2BED8 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Samt1A2BED8 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Samt1A2BED8 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Samt1A2BED8 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Samt1A2BED8 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.7 ms