Protein–RNA interactions for Protein: A2APC3

Ttll9, Probable tubulin polyglutamylase TTLL9, mousemouse

Predictions only

Length 461 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttll9A2APC3 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ttll9A2APC3 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ttll9A2APC3 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ttll9A2APC3 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ttll9A2APC3 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ttll9A2APC3 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ttll9A2APC3 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ttll9A2APC3 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ttll9A2APC3 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ttll9A2APC3 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ttll9A2APC3 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ttll9A2APC3 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ttll9A2APC3 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ttll9A2APC3 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ttll9A2APC3 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ttll9A2APC3 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ttll9A2APC3 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ttll9A2APC3 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ttll9A2APC3 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ttll9A2APC3 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ttll9A2APC3 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ttll9A2APC3 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ttll9A2APC3 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ttll9A2APC3 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Ttll9A2APC3 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ttll9A2APC3 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ttll9A2APC3 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ttll9A2APC3 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ttll9A2APC3 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ttll9A2APC3 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ttll9A2APC3 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ttll9A2APC3 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ttll9A2APC3 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ttll9A2APC3 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ttll9A2APC3 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Ttll9A2APC3 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ttll9A2APC3 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Ttll9A2APC3 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ttll9A2APC3 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ttll9A2APC3 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ttll9A2APC3 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ttll9A2APC3 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ttll9A2APC3 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ttll9A2APC3 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ttll9A2APC3 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ttll9A2APC3 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ttll9A2APC3 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ttll9A2APC3 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ttll9A2APC3 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ttll9A2APC3 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ttll9A2APC3 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Ttll9A2APC3 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ttll9A2APC3 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ttll9A2APC3 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ttll9A2APC3 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ttll9A2APC3 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Ttll9A2APC3 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Ttll9A2APC3 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ttll9A2APC3 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ttll9A2APC3 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ttll9A2APC3 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ttll9A2APC3 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ttll9A2APC3 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ttll9A2APC3 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ttll9A2APC3 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ttll9A2APC3 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ttll9A2APC3 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ttll9A2APC3 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ttll9A2APC3 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ttll9A2APC3 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ttll9A2APC3 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ttll9A2APC3 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ttll9A2APC3 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ttll9A2APC3 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ttll9A2APC3 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ttll9A2APC3 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ttll9A2APC3 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ttll9A2APC3 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ttll9A2APC3 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ttll9A2APC3 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ttll9A2APC3 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ttll9A2APC3 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ttll9A2APC3 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ttll9A2APC3 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ttll9A2APC3 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ttll9A2APC3 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ttll9A2APC3 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ttll9A2APC3 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ttll9A2APC3 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ttll9A2APC3 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ttll9A2APC3 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Ttll9A2APC3 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ttll9A2APC3 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ttll9A2APC3 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ttll9A2APC3 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Ttll9A2APC3 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ttll9A2APC3 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ttll9A2APC3 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ttll9A2APC3 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ttll9A2APC3 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.4 ms