Protein–RNA interactions for Protein: A2ANU3

Syndig1, Synapse differentiation-inducing gene protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syndig1A2ANU3 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Syndig1A2ANU3 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Syndig1A2ANU3 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Syndig1A2ANU3 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Syndig1A2ANU3 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Syndig1A2ANU3 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Syndig1A2ANU3 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Syndig1A2ANU3 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Syndig1A2ANU3 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Syndig1A2ANU3 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Syndig1A2ANU3 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Syndig1A2ANU3 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Syndig1A2ANU3 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Syndig1A2ANU3 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Syndig1A2ANU3 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Syndig1A2ANU3 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Syndig1A2ANU3 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Syndig1A2ANU3 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Syndig1A2ANU3 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Syndig1A2ANU3 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Syndig1A2ANU3 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Syndig1A2ANU3 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Syndig1A2ANU3 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Syndig1A2ANU3 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Syndig1A2ANU3 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Syndig1A2ANU3 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Syndig1A2ANU3 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Syndig1A2ANU3 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Syndig1A2ANU3 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Syndig1A2ANU3 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Syndig1A2ANU3 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Syndig1A2ANU3 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Syndig1A2ANU3 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Syndig1A2ANU3 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Syndig1A2ANU3 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Syndig1A2ANU3 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Syndig1A2ANU3 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Syndig1A2ANU3 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Syndig1A2ANU3 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Syndig1A2ANU3 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Syndig1A2ANU3 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Syndig1A2ANU3 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Syndig1A2ANU3 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Syndig1A2ANU3 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Syndig1A2ANU3 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Syndig1A2ANU3 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Syndig1A2ANU3 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Syndig1A2ANU3 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Syndig1A2ANU3 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Syndig1A2ANU3 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Syndig1A2ANU3 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Syndig1A2ANU3 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Syndig1A2ANU3 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Syndig1A2ANU3 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Syndig1A2ANU3 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Syndig1A2ANU3 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Syndig1A2ANU3 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Syndig1A2ANU3 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Syndig1A2ANU3 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Syndig1A2ANU3 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Syndig1A2ANU3 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Syndig1A2ANU3 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Syndig1A2ANU3 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Syndig1A2ANU3 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Syndig1A2ANU3 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Syndig1A2ANU3 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Syndig1A2ANU3 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Syndig1A2ANU3 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Syndig1A2ANU3 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Syndig1A2ANU3 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Syndig1A2ANU3 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Syndig1A2ANU3 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Syndig1A2ANU3 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Syndig1A2ANU3 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Syndig1A2ANU3 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Syndig1A2ANU3 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Syndig1A2ANU3 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Syndig1A2ANU3 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Syndig1A2ANU3 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Syndig1A2ANU3 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Syndig1A2ANU3 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Syndig1A2ANU3 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Syndig1A2ANU3 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Syndig1A2ANU3 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Syndig1A2ANU3 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Syndig1A2ANU3 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Syndig1A2ANU3 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Syndig1A2ANU3 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Syndig1A2ANU3 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Syndig1A2ANU3 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Syndig1A2ANU3 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Syndig1A2ANU3 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Syndig1A2ANU3 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Syndig1A2ANU3 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Syndig1A2ANU3 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Syndig1A2ANU3 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Syndig1A2ANU3 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Syndig1A2ANU3 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Syndig1A2ANU3 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Syndig1A2ANU3 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.6 ms