Protein–RNA interactions for Protein: A2AKB4

Frmpd1, FERM and PDZ domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,549 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Frmpd1A2AKB4 Gm42929-201ENSMUST00000198374 1286 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Frmpd1A2AKB4 Gm9445-201ENSMUST00000207454 1285 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Frmpd1A2AKB4 Gm8227-201ENSMUST00000223306 571 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Frmpd1A2AKB4 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Frmpd1A2AKB4 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Frmpd1A2AKB4 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Frmpd1A2AKB4 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Frmpd1A2AKB4 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Frmpd1A2AKB4 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Frmpd1A2AKB4 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Frmpd1A2AKB4 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Frmpd1A2AKB4 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Frmpd1A2AKB4 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Frmpd1A2AKB4 Ccdc103-202ENSMUST00000159834 1156 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Frmpd1A2AKB4 Rps4l-202ENSMUST00000204242 789 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Frmpd1A2AKB4 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Frmpd1A2AKB4 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Frmpd1A2AKB4 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Frmpd1A2AKB4 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Frmpd1A2AKB4 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Frmpd1A2AKB4 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Frmpd1A2AKB4 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Frmpd1A2AKB4 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Frmpd1A2AKB4 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Frmpd1A2AKB4 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Frmpd1A2AKB4 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Frmpd1A2AKB4 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Frmpd1A2AKB4 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Frmpd1A2AKB4 Napsa-201ENSMUST00000002274 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Frmpd1A2AKB4 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Frmpd1A2AKB4 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Frmpd1A2AKB4 Bcs1l-203ENSMUST00000113733 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Frmpd1A2AKB4 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Frmpd1A2AKB4 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Frmpd1A2AKB4 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Frmpd1A2AKB4 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Frmpd1A2AKB4 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Frmpd1A2AKB4 Zfp157-202ENSMUST00000100524 869 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Frmpd1A2AKB4 Gm12315-201ENSMUST00000151599 911 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Frmpd1A2AKB4 Gm25261-201ENSMUST00000157416 134 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Frmpd1A2AKB4 Gm5441-202ENSMUST00000190132 449 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Frmpd1A2AKB4 Gm5363-201ENSMUST00000211927 938 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Frmpd1A2AKB4 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Frmpd1A2AKB4 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Frmpd1A2AKB4 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Frmpd1A2AKB4 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Frmpd1A2AKB4 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Frmpd1A2AKB4 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Frmpd1A2AKB4 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Frmpd1A2AKB4 Wsb2-ps-201ENSMUST00000117937 1217 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Frmpd1A2AKB4 Gm4577-201ENSMUST00000135203 716 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Frmpd1A2AKB4 Pcp2-206ENSMUST00000144977 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Frmpd1A2AKB4 Gm2991-201ENSMUST00000173338 480 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Frmpd1A2AKB4 Mtus2-202ENSMUST00000085554 1009 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Frmpd1A2AKB4 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Frmpd1A2AKB4 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Frmpd1A2AKB4 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Frmpd1A2AKB4 Chchd3-201ENSMUST00000066379 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Frmpd1A2AKB4 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Frmpd1A2AKB4 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Frmpd1A2AKB4 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Frmpd1A2AKB4 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Frmpd1A2AKB4 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Frmpd1A2AKB4 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Frmpd1A2AKB4 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Frmpd1A2AKB4 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Frmpd1A2AKB4 Atp6v0e-201ENSMUST00000015719 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Frmpd1A2AKB4 Tmem255b-202ENSMUST00000167505 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Frmpd1A2AKB4 Gm27017-201ENSMUST00000183031 656 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Frmpd1A2AKB4 1500004A13Rik-208ENSMUST00000184958 823 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Frmpd1A2AKB4 Chfr-212ENSMUST00000200038 606 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Frmpd1A2AKB4 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Frmpd1A2AKB4 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Frmpd1A2AKB4 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Frmpd1A2AKB4 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Frmpd1A2AKB4 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Frmpd1A2AKB4 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Frmpd1A2AKB4 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Frmpd1A2AKB4 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Frmpd1A2AKB4 Gm43289-201ENSMUST00000200537 1475 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Frmpd1A2AKB4 4933424N20Rik-201ENSMUST00000200749 1463 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Frmpd1A2AKB4 Add2-203ENSMUST00000203279 1454 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Frmpd1A2AKB4 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Frmpd1A2AKB4 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Frmpd1A2AKB4 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Frmpd1A2AKB4 Lrguk-202ENSMUST00000101564 967 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Frmpd1A2AKB4 Asgr1-201ENSMUST00000018699 1259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Frmpd1A2AKB4 Txndc17-201ENSMUST00000021158 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Frmpd1A2AKB4 Gm4935-201ENSMUST00000221316 1198 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Frmpd1A2AKB4 Rpl24-201ENSMUST00000023269 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Frmpd1A2AKB4 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Frmpd1A2AKB4 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Frmpd1A2AKB4 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Frmpd1A2AKB4 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Frmpd1A2AKB4 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Frmpd1A2AKB4 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Frmpd1A2AKB4 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Frmpd1A2AKB4 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Frmpd1A2AKB4 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Frmpd1A2AKB4 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.7 ms