Protein–RNA interactions for Protein: A2AJB9

Lcn6, LCN6 isoform alpha, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lcn6A2AJB9 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lcn6A2AJB9 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Lcn6A2AJB9 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lcn6A2AJB9 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lcn6A2AJB9 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lcn6A2AJB9 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lcn6A2AJB9 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lcn6A2AJB9 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Lcn6A2AJB9 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lcn6A2AJB9 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lcn6A2AJB9 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lcn6A2AJB9 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lcn6A2AJB9 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lcn6A2AJB9 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lcn6A2AJB9 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lcn6A2AJB9 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
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Lcn6A2AJB9 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lcn6A2AJB9 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
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Lcn6A2AJB9 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lcn6A2AJB9 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lcn6A2AJB9 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lcn6A2AJB9 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lcn6A2AJB9 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Lcn6A2AJB9 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lcn6A2AJB9 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lcn6A2AJB9 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Lcn6A2AJB9 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lcn6A2AJB9 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Lcn6A2AJB9 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Lcn6A2AJB9 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lcn6A2AJB9 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lcn6A2AJB9 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lcn6A2AJB9 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lcn6A2AJB9 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Lcn6A2AJB9 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lcn6A2AJB9 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lcn6A2AJB9 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lcn6A2AJB9 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lcn6A2AJB9 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lcn6A2AJB9 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lcn6A2AJB9 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lcn6A2AJB9 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lcn6A2AJB9 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lcn6A2AJB9 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lcn6A2AJB9 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lcn6A2AJB9 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lcn6A2AJB9 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lcn6A2AJB9 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lcn6A2AJB9 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lcn6A2AJB9 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lcn6A2AJB9 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lcn6A2AJB9 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lcn6A2AJB9 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lcn6A2AJB9 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lcn6A2AJB9 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lcn6A2AJB9 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Lcn6A2AJB9 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Lcn6A2AJB9 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Lcn6A2AJB9 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lcn6A2AJB9 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lcn6A2AJB9 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lcn6A2AJB9 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lcn6A2AJB9 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
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Lcn6A2AJB9 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lcn6A2AJB9 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lcn6A2AJB9 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lcn6A2AJB9 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
Lcn6A2AJB9 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Lcn6A2AJB9 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Lcn6A2AJB9 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Lcn6A2AJB9 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Lcn6A2AJB9 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lcn6A2AJB9 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lcn6A2AJB9 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lcn6A2AJB9 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lcn6A2AJB9 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lcn6A2AJB9 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lcn6A2AJB9 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lcn6A2AJB9 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lcn6A2AJB9 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
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Lcn6A2AJB9 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
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Lcn6A2AJB9 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
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Lcn6A2AJB9 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
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Lcn6A2AJB9 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lcn6A2AJB9 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
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Lcn6A2AJB9 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lcn6A2AJB9 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lcn6A2AJB9 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lcn6A2AJB9 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lcn6A2AJB9 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
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