Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2V5

Hdac6, Histone deacetylase 6, mousemouse

Predictions only

Length 1,149 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac6Q9Z2V5 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hdac6Q9Z2V5 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hdac6Q9Z2V5 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hdac6Q9Z2V5 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hdac6Q9Z2V5 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hdac6Q9Z2V5 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hdac6Q9Z2V5 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hdac6Q9Z2V5 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hdac6Q9Z2V5 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hdac6Q9Z2V5 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hdac6Q9Z2V5 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hdac6Q9Z2V5 Mrps24-205ENSMUST00000154330 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hdac6Q9Z2V5 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hdac6Q9Z2V5 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hdac6Q9Z2V5 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Hdac6Q9Z2V5 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hdac6Q9Z2V5 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hdac6Q9Z2V5 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hdac6Q9Z2V5 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hdac6Q9Z2V5 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hdac6Q9Z2V5 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hdac6Q9Z2V5 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hdac6Q9Z2V5 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hdac6Q9Z2V5 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hdac6Q9Z2V5 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hdac6Q9Z2V5 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hdac6Q9Z2V5 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hdac6Q9Z2V5 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hdac6Q9Z2V5 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hdac6Q9Z2V5 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hdac6Q9Z2V5 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hdac6Q9Z2V5 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hdac6Q9Z2V5 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hdac6Q9Z2V5 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hdac6Q9Z2V5 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Hdac6Q9Z2V5 Gm14285-201ENSMUST00000146049 380 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hdac6Q9Z2V5 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hdac6Q9Z2V5 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Hdac6Q9Z2V5 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Hdac6Q9Z2V5 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hdac6Q9Z2V5 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hdac6Q9Z2V5 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hdac6Q9Z2V5 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hdac6Q9Z2V5 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hdac6Q9Z2V5 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hdac6Q9Z2V5 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hdac6Q9Z2V5 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hdac6Q9Z2V5 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hdac6Q9Z2V5 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hdac6Q9Z2V5 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hdac6Q9Z2V5 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hdac6Q9Z2V5 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hdac6Q9Z2V5 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hdac6Q9Z2V5 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
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Hdac6Q9Z2V5 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hdac6Q9Z2V5 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
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Hdac6Q9Z2V5 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
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Hdac6Q9Z2V5 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
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Hdac6Q9Z2V5 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hdac6Q9Z2V5 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
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Hdac6Q9Z2V5 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hdac6Q9Z2V5 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hdac6Q9Z2V5 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hdac6Q9Z2V5 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hdac6Q9Z2V5 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hdac6Q9Z2V5 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
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Hdac6Q9Z2V5 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hdac6Q9Z2V5 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hdac6Q9Z2V5 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hdac6Q9Z2V5 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
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Hdac6Q9Z2V5 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hdac6Q9Z2V5 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hdac6Q9Z2V5 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hdac6Q9Z2V5 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hdac6Q9Z2V5 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hdac6Q9Z2V5 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hdac6Q9Z2V5 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hdac6Q9Z2V5 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hdac6Q9Z2V5 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Hdac6Q9Z2V5 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hdac6Q9Z2V5 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hdac6Q9Z2V5 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hdac6Q9Z2V5 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hdac6Q9Z2V5 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hdac6Q9Z2V5 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hdac6Q9Z2V5 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hdac6Q9Z2V5 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hdac6Q9Z2V5 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
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