Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2P8

Vamp5, Vesicle-associated membrane protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp5Q9Z2P8 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Vamp5Q9Z2P8 Hid1-202ENSMUST00000106542 3276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Vamp5Q9Z2P8 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Vamp5Q9Z2P8 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Vamp5Q9Z2P8 Xndc1-201ENSMUST00000094130 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Vamp5Q9Z2P8 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Vamp5Q9Z2P8 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Vamp5Q9Z2P8 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Vamp5Q9Z2P8 Aco1-201ENSMUST00000102973 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Vamp5Q9Z2P8 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Vamp5Q9Z2P8 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Vamp5Q9Z2P8 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Vamp5Q9Z2P8 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Vamp5Q9Z2P8 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Vamp5Q9Z2P8 Insrr-201ENSMUST00000029711 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Vamp5Q9Z2P8 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Vamp5Q9Z2P8 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Vamp5Q9Z2P8 Tmem30c-202ENSMUST00000119407 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Vamp5Q9Z2P8 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Vamp5Q9Z2P8 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Vamp5Q9Z2P8 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Vamp5Q9Z2P8 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Vamp5Q9Z2P8 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Vamp5Q9Z2P8 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Vamp5Q9Z2P8 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Vamp5Q9Z2P8 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Vamp5Q9Z2P8 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Vamp5Q9Z2P8 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Vamp5Q9Z2P8 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Vamp5Q9Z2P8 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Vamp5Q9Z2P8 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Vamp5Q9Z2P8 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Vamp5Q9Z2P8 Slc33a1-201ENSMUST00000029402 3150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Vamp5Q9Z2P8 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Vamp5Q9Z2P8 Atxn7l3b-201ENSMUST00000099276 3566 ntAPPRIS P1 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Vamp5Q9Z2P8 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Vamp5Q9Z2P8 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Vamp5Q9Z2P8 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Vamp5Q9Z2P8 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Vamp5Q9Z2P8 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Vamp5Q9Z2P8 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Vamp5Q9Z2P8 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Vamp5Q9Z2P8 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Vamp5Q9Z2P8 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Vamp5Q9Z2P8 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Vamp5Q9Z2P8 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Vamp5Q9Z2P8 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Vamp5Q9Z2P8 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Vamp5Q9Z2P8 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Vamp5Q9Z2P8 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Vamp5Q9Z2P8 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Vamp5Q9Z2P8 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Vamp5Q9Z2P8 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Vamp5Q9Z2P8 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Vamp5Q9Z2P8 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Vamp5Q9Z2P8 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Vamp5Q9Z2P8 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Vamp5Q9Z2P8 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Vamp5Q9Z2P8 Wnt9b-201ENSMUST00000018630 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Vamp5Q9Z2P8 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Vamp5Q9Z2P8 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Vamp5Q9Z2P8 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Vamp5Q9Z2P8 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Vamp5Q9Z2P8 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Vamp5Q9Z2P8 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Vamp5Q9Z2P8 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Vamp5Q9Z2P8 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Vamp5Q9Z2P8 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Vamp5Q9Z2P8 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Vamp5Q9Z2P8 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Vamp5Q9Z2P8 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Vamp5Q9Z2P8 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Vamp5Q9Z2P8 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Vamp5Q9Z2P8 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Vamp5Q9Z2P8 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Vamp5Q9Z2P8 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Vamp5Q9Z2P8 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Vamp5Q9Z2P8 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Vamp5Q9Z2P8 Zfp516-202ENSMUST00000171238 7725 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Vamp5Q9Z2P8 Zfp516-201ENSMUST00000071233 7703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Vamp5Q9Z2P8 Micu1-204ENSMUST00000165563 2442 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Vamp5Q9Z2P8 Zfp148-202ENSMUST00000165418 9431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Vamp5Q9Z2P8 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Vamp5Q9Z2P8 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Vamp5Q9Z2P8 Bace1-201ENSMUST00000034591 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Vamp5Q9Z2P8 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Vamp5Q9Z2P8 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Vamp5Q9Z2P8 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Vamp5Q9Z2P8 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Vamp5Q9Z2P8 Corin-201ENSMUST00000005352 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Vamp5Q9Z2P8 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Vamp5Q9Z2P8 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Vamp5Q9Z2P8 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Vamp5Q9Z2P8 Amer2-201ENSMUST00000022561 10506 ntAPPRIS P1 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Vamp5Q9Z2P8 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Vamp5Q9Z2P8 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Vamp5Q9Z2P8 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Vamp5Q9Z2P8 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Vamp5Q9Z2P8 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Vamp5Q9Z2P8 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.5 ms