Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2E2

Mbd1, Methyl-CpG-binding domain protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 636 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mbd1Q9Z2E2 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Mbd1Q9Z2E2 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Mbd1Q9Z2E2 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Mbd1Q9Z2E2 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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Mbd1Q9Z2E2 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Mbd1Q9Z2E2 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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Mbd1Q9Z2E2 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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Mbd1Q9Z2E2 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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Mbd1Q9Z2E2 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Mbd1Q9Z2E2 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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Mbd1Q9Z2E2 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Mbd1Q9Z2E2 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
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Mbd1Q9Z2E2 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
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Mbd1Q9Z2E2 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Mbd1Q9Z2E2 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Mbd1Q9Z2E2 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Mbd1Q9Z2E2 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Mbd1Q9Z2E2 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Mbd1Q9Z2E2 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Mbd1Q9Z2E2 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Mbd1Q9Z2E2 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Mbd1Q9Z2E2 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Mbd1Q9Z2E2 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Mbd1Q9Z2E2 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Mbd1Q9Z2E2 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Mbd1Q9Z2E2 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Mbd1Q9Z2E2 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Mbd1Q9Z2E2 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Mbd1Q9Z2E2 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Mbd1Q9Z2E2 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Mbd1Q9Z2E2 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Mbd1Q9Z2E2 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Mbd1Q9Z2E2 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Mbd1Q9Z2E2 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Mbd1Q9Z2E2 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Mbd1Q9Z2E2 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Mbd1Q9Z2E2 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Mbd1Q9Z2E2 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Mbd1Q9Z2E2 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Mbd1Q9Z2E2 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Mbd1Q9Z2E2 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Mbd1Q9Z2E2 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Mbd1Q9Z2E2 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Mbd1Q9Z2E2 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Mbd1Q9Z2E2 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Mbd1Q9Z2E2 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Mbd1Q9Z2E2 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Mbd1Q9Z2E2 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Mbd1Q9Z2E2 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Mbd1Q9Z2E2 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Mbd1Q9Z2E2 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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