Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2D8

Mbd3, Methyl-CpG-binding domain protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mbd3Q9Z2D8 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Mbd3Q9Z2D8 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Mbd3Q9Z2D8 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Mbd3Q9Z2D8 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Mbd3Q9Z2D8 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Mbd3Q9Z2D8 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Mbd3Q9Z2D8 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Mbd3Q9Z2D8 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Mbd3Q9Z2D8 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Mbd3Q9Z2D8 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Mbd3Q9Z2D8 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Mbd3Q9Z2D8 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Mbd3Q9Z2D8 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Mbd3Q9Z2D8 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Mbd3Q9Z2D8 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Mbd3Q9Z2D8 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Mbd3Q9Z2D8 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Mbd3Q9Z2D8 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Mbd3Q9Z2D8 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Mbd3Q9Z2D8 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Mbd3Q9Z2D8 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Mbd3Q9Z2D8 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Mbd3Q9Z2D8 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Mbd3Q9Z2D8 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Mbd3Q9Z2D8 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Mbd3Q9Z2D8 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Mbd3Q9Z2D8 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Mbd3Q9Z2D8 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Mbd3Q9Z2D8 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Mbd3Q9Z2D8 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Mbd3Q9Z2D8 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Mbd3Q9Z2D8 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Mbd3Q9Z2D8 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Mbd3Q9Z2D8 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Mbd3Q9Z2D8 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Mbd3Q9Z2D8 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Mbd3Q9Z2D8 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Mbd3Q9Z2D8 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Mbd3Q9Z2D8 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Mbd3Q9Z2D8 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Mbd3Q9Z2D8 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Mbd3Q9Z2D8 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Mbd3Q9Z2D8 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Mbd3Q9Z2D8 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Mbd3Q9Z2D8 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Mbd3Q9Z2D8 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Mbd3Q9Z2D8 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Mbd3Q9Z2D8 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Mbd3Q9Z2D8 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Mbd3Q9Z2D8 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Mbd3Q9Z2D8 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Mbd3Q9Z2D8 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Mbd3Q9Z2D8 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Mbd3Q9Z2D8 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Mbd3Q9Z2D8 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Mbd3Q9Z2D8 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Mbd3Q9Z2D8 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Mbd3Q9Z2D8 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Mbd3Q9Z2D8 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Mbd3Q9Z2D8 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Mbd3Q9Z2D8 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Mbd3Q9Z2D8 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Mbd3Q9Z2D8 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Mbd3Q9Z2D8 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Mbd3Q9Z2D8 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Mbd3Q9Z2D8 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Mbd3Q9Z2D8 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Mbd3Q9Z2D8 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Mbd3Q9Z2D8 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Mbd3Q9Z2D8 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Mbd3Q9Z2D8 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Mbd3Q9Z2D8 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Mbd3Q9Z2D8 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Mbd3Q9Z2D8 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Mbd3Q9Z2D8 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Mbd3Q9Z2D8 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Mbd3Q9Z2D8 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Mbd3Q9Z2D8 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Mbd3Q9Z2D8 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Mbd3Q9Z2D8 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Mbd3Q9Z2D8 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Mbd3Q9Z2D8 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Mbd3Q9Z2D8 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Mbd3Q9Z2D8 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Mbd3Q9Z2D8 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Mbd3Q9Z2D8 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Mbd3Q9Z2D8 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Mbd3Q9Z2D8 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Mbd3Q9Z2D8 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Mbd3Q9Z2D8 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Mbd3Q9Z2D8 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Mbd3Q9Z2D8 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Mbd3Q9Z2D8 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Mbd3Q9Z2D8 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Mbd3Q9Z2D8 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Mbd3Q9Z2D8 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Mbd3Q9Z2D8 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Mbd3Q9Z2D8 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Mbd3Q9Z2D8 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Mbd3Q9Z2D8 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms