Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2A0

Pdpk1, 3-phosphoinositide-dependent protein kinase 1, mousemouse

Predictions only

Length 559 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdpk1Q9Z2A0 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pdpk1Q9Z2A0 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Pdpk1Q9Z2A0 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pdpk1Q9Z2A0 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pdpk1Q9Z2A0 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pdpk1Q9Z2A0 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pdpk1Q9Z2A0 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pdpk1Q9Z2A0 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pdpk1Q9Z2A0 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pdpk1Q9Z2A0 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pdpk1Q9Z2A0 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pdpk1Q9Z2A0 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pdpk1Q9Z2A0 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pdpk1Q9Z2A0 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pdpk1Q9Z2A0 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pdpk1Q9Z2A0 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pdpk1Q9Z2A0 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pdpk1Q9Z2A0 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pdpk1Q9Z2A0 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pdpk1Q9Z2A0 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pdpk1Q9Z2A0 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pdpk1Q9Z2A0 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pdpk1Q9Z2A0 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pdpk1Q9Z2A0 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pdpk1Q9Z2A0 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pdpk1Q9Z2A0 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pdpk1Q9Z2A0 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pdpk1Q9Z2A0 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pdpk1Q9Z2A0 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pdpk1Q9Z2A0 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pdpk1Q9Z2A0 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pdpk1Q9Z2A0 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Pdpk1Q9Z2A0 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pdpk1Q9Z2A0 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pdpk1Q9Z2A0 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pdpk1Q9Z2A0 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pdpk1Q9Z2A0 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Pdpk1Q9Z2A0 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pdpk1Q9Z2A0 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Pdpk1Q9Z2A0 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pdpk1Q9Z2A0 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pdpk1Q9Z2A0 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pdpk1Q9Z2A0 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pdpk1Q9Z2A0 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pdpk1Q9Z2A0 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pdpk1Q9Z2A0 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pdpk1Q9Z2A0 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pdpk1Q9Z2A0 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Pdpk1Q9Z2A0 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pdpk1Q9Z2A0 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pdpk1Q9Z2A0 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pdpk1Q9Z2A0 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pdpk1Q9Z2A0 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pdpk1Q9Z2A0 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pdpk1Q9Z2A0 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Pdpk1Q9Z2A0 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pdpk1Q9Z2A0 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pdpk1Q9Z2A0 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pdpk1Q9Z2A0 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Pdpk1Q9Z2A0 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pdpk1Q9Z2A0 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pdpk1Q9Z2A0 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pdpk1Q9Z2A0 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pdpk1Q9Z2A0 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pdpk1Q9Z2A0 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pdpk1Q9Z2A0 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Pdpk1Q9Z2A0 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pdpk1Q9Z2A0 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pdpk1Q9Z2A0 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pdpk1Q9Z2A0 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pdpk1Q9Z2A0 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pdpk1Q9Z2A0 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pdpk1Q9Z2A0 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pdpk1Q9Z2A0 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pdpk1Q9Z2A0 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pdpk1Q9Z2A0 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pdpk1Q9Z2A0 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pdpk1Q9Z2A0 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pdpk1Q9Z2A0 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Pdpk1Q9Z2A0 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pdpk1Q9Z2A0 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pdpk1Q9Z2A0 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pdpk1Q9Z2A0 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pdpk1Q9Z2A0 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pdpk1Q9Z2A0 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pdpk1Q9Z2A0 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Pdpk1Q9Z2A0 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pdpk1Q9Z2A0 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pdpk1Q9Z2A0 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pdpk1Q9Z2A0 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pdpk1Q9Z2A0 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pdpk1Q9Z2A0 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pdpk1Q9Z2A0 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pdpk1Q9Z2A0 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pdpk1Q9Z2A0 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pdpk1Q9Z2A0 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pdpk1Q9Z2A0 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pdpk1Q9Z2A0 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pdpk1Q9Z2A0 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pdpk1Q9Z2A0 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.9 ms