Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z262

Cldn6, Claudin-6, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn6Q9Z262 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cldn6Q9Z262 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cldn6Q9Z262 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cldn6Q9Z262 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cldn6Q9Z262 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cldn6Q9Z262 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cldn6Q9Z262 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cldn6Q9Z262 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cldn6Q9Z262 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cldn6Q9Z262 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cldn6Q9Z262 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cldn6Q9Z262 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cldn6Q9Z262 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cldn6Q9Z262 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Cldn6Q9Z262 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cldn6Q9Z262 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cldn6Q9Z262 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Cldn6Q9Z262 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Cldn6Q9Z262 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Cldn6Q9Z262 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cldn6Q9Z262 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Cldn6Q9Z262 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cldn6Q9Z262 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cldn6Q9Z262 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cldn6Q9Z262 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cldn6Q9Z262 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cldn6Q9Z262 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cldn6Q9Z262 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cldn6Q9Z262 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cldn6Q9Z262 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cldn6Q9Z262 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cldn6Q9Z262 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cldn6Q9Z262 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cldn6Q9Z262 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cldn6Q9Z262 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cldn6Q9Z262 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cldn6Q9Z262 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cldn6Q9Z262 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cldn6Q9Z262 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cldn6Q9Z262 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cldn6Q9Z262 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cldn6Q9Z262 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cldn6Q9Z262 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cldn6Q9Z262 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cldn6Q9Z262 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cldn6Q9Z262 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cldn6Q9Z262 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cldn6Q9Z262 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cldn6Q9Z262 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cldn6Q9Z262 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cldn6Q9Z262 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cldn6Q9Z262 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Cldn6Q9Z262 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cldn6Q9Z262 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cldn6Q9Z262 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cldn6Q9Z262 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cldn6Q9Z262 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cldn6Q9Z262 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cldn6Q9Z262 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cldn6Q9Z262 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cldn6Q9Z262 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cldn6Q9Z262 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cldn6Q9Z262 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cldn6Q9Z262 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cldn6Q9Z262 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cldn6Q9Z262 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cldn6Q9Z262 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cldn6Q9Z262 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cldn6Q9Z262 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cldn6Q9Z262 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cldn6Q9Z262 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cldn6Q9Z262 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cldn6Q9Z262 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cldn6Q9Z262 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cldn6Q9Z262 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cldn6Q9Z262 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cldn6Q9Z262 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cldn6Q9Z262 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cldn6Q9Z262 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cldn6Q9Z262 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cldn6Q9Z262 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cldn6Q9Z262 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cldn6Q9Z262 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cldn6Q9Z262 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cldn6Q9Z262 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cldn6Q9Z262 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cldn6Q9Z262 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cldn6Q9Z262 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cldn6Q9Z262 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Cldn6Q9Z262 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Cldn6Q9Z262 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cldn6Q9Z262 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cldn6Q9Z262 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cldn6Q9Z262 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cldn6Q9Z262 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cldn6Q9Z262 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cldn6Q9Z262 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cldn6Q9Z262 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cldn6Q9Z262 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cldn6Q9Z262 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.9 ms