Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1Z0

Uso1, General vesicular transport factor p115, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 959 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uso1Q9Z1Z0 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Uso1Q9Z1Z0 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Uso1Q9Z1Z0 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Uso1Q9Z1Z0 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Uso1Q9Z1Z0 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Uso1Q9Z1Z0 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Uso1Q9Z1Z0 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Uso1Q9Z1Z0 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Uso1Q9Z1Z0 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Uso1Q9Z1Z0 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Uso1Q9Z1Z0 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Uso1Q9Z1Z0 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Uso1Q9Z1Z0 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Uso1Q9Z1Z0 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Uso1Q9Z1Z0 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Uso1Q9Z1Z0 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Uso1Q9Z1Z0 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Uso1Q9Z1Z0 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Uso1Q9Z1Z0 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Uso1Q9Z1Z0 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Uso1Q9Z1Z0 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Uso1Q9Z1Z0 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Uso1Q9Z1Z0 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Uso1Q9Z1Z0 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Uso1Q9Z1Z0 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Uso1Q9Z1Z0 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Uso1Q9Z1Z0 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Uso1Q9Z1Z0 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Uso1Q9Z1Z0 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Uso1Q9Z1Z0 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Uso1Q9Z1Z0 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Uso1Q9Z1Z0 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Uso1Q9Z1Z0 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Uso1Q9Z1Z0 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Uso1Q9Z1Z0 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Uso1Q9Z1Z0 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Uso1Q9Z1Z0 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Uso1Q9Z1Z0 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Uso1Q9Z1Z0 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Uso1Q9Z1Z0 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Uso1Q9Z1Z0 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Uso1Q9Z1Z0 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Uso1Q9Z1Z0 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Uso1Q9Z1Z0 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Uso1Q9Z1Z0 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Uso1Q9Z1Z0 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Uso1Q9Z1Z0 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Uso1Q9Z1Z0 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Uso1Q9Z1Z0 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Uso1Q9Z1Z0 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Uso1Q9Z1Z0 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Uso1Q9Z1Z0 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Uso1Q9Z1Z0 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Uso1Q9Z1Z0 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Uso1Q9Z1Z0 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Uso1Q9Z1Z0 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Uso1Q9Z1Z0 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Uso1Q9Z1Z0 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Uso1Q9Z1Z0 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Uso1Q9Z1Z0 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Uso1Q9Z1Z0 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Uso1Q9Z1Z0 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Uso1Q9Z1Z0 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Uso1Q9Z1Z0 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Uso1Q9Z1Z0 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Uso1Q9Z1Z0 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Uso1Q9Z1Z0 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Uso1Q9Z1Z0 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Uso1Q9Z1Z0 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Uso1Q9Z1Z0 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Uso1Q9Z1Z0 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Uso1Q9Z1Z0 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Uso1Q9Z1Z0 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Uso1Q9Z1Z0 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Uso1Q9Z1Z0 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Uso1Q9Z1Z0 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Uso1Q9Z1Z0 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Uso1Q9Z1Z0 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Uso1Q9Z1Z0 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Uso1Q9Z1Z0 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Uso1Q9Z1Z0 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Uso1Q9Z1Z0 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Uso1Q9Z1Z0 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Uso1Q9Z1Z0 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Uso1Q9Z1Z0 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Uso1Q9Z1Z0 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Uso1Q9Z1Z0 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Uso1Q9Z1Z0 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Uso1Q9Z1Z0 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Uso1Q9Z1Z0 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Uso1Q9Z1Z0 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Uso1Q9Z1Z0 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Uso1Q9Z1Z0 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Uso1Q9Z1Z0 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Uso1Q9Z1Z0 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Uso1Q9Z1Z0 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Uso1Q9Z1Z0 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Uso1Q9Z1Z0 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Uso1Q9Z1Z0 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Uso1Q9Z1Z0 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
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