Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1Q9

Vars, Valine--tRNA ligase, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VarsQ9Z1Q9 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
VarsQ9Z1Q9 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
VarsQ9Z1Q9 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
VarsQ9Z1Q9 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
VarsQ9Z1Q9 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
VarsQ9Z1Q9 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
VarsQ9Z1Q9 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
VarsQ9Z1Q9 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
VarsQ9Z1Q9 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
VarsQ9Z1Q9 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
VarsQ9Z1Q9 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
VarsQ9Z1Q9 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
VarsQ9Z1Q9 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
VarsQ9Z1Q9 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
VarsQ9Z1Q9 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
VarsQ9Z1Q9 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
VarsQ9Z1Q9 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
VarsQ9Z1Q9 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
VarsQ9Z1Q9 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
VarsQ9Z1Q9 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
VarsQ9Z1Q9 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
VarsQ9Z1Q9 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
VarsQ9Z1Q9 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
VarsQ9Z1Q9 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
VarsQ9Z1Q9 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
VarsQ9Z1Q9 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
VarsQ9Z1Q9 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
VarsQ9Z1Q9 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
VarsQ9Z1Q9 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
VarsQ9Z1Q9 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
VarsQ9Z1Q9 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
VarsQ9Z1Q9 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
VarsQ9Z1Q9 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
VarsQ9Z1Q9 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
VarsQ9Z1Q9 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
VarsQ9Z1Q9 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
VarsQ9Z1Q9 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
VarsQ9Z1Q9 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
VarsQ9Z1Q9 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
VarsQ9Z1Q9 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
VarsQ9Z1Q9 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
VarsQ9Z1Q9 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
VarsQ9Z1Q9 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
VarsQ9Z1Q9 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
VarsQ9Z1Q9 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
VarsQ9Z1Q9 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
VarsQ9Z1Q9 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
VarsQ9Z1Q9 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
VarsQ9Z1Q9 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
VarsQ9Z1Q9 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
VarsQ9Z1Q9 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
VarsQ9Z1Q9 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
VarsQ9Z1Q9 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
VarsQ9Z1Q9 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
VarsQ9Z1Q9 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
VarsQ9Z1Q9 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
VarsQ9Z1Q9 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
VarsQ9Z1Q9 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
VarsQ9Z1Q9 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
VarsQ9Z1Q9 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
VarsQ9Z1Q9 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
VarsQ9Z1Q9 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
VarsQ9Z1Q9 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
VarsQ9Z1Q9 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
VarsQ9Z1Q9 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
VarsQ9Z1Q9 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
VarsQ9Z1Q9 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
VarsQ9Z1Q9 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
VarsQ9Z1Q9 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
VarsQ9Z1Q9 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
VarsQ9Z1Q9 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
VarsQ9Z1Q9 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
VarsQ9Z1Q9 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
VarsQ9Z1Q9 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
VarsQ9Z1Q9 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
VarsQ9Z1Q9 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
VarsQ9Z1Q9 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
VarsQ9Z1Q9 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
VarsQ9Z1Q9 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
VarsQ9Z1Q9 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
VarsQ9Z1Q9 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
VarsQ9Z1Q9 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
VarsQ9Z1Q9 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
VarsQ9Z1Q9 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
VarsQ9Z1Q9 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
VarsQ9Z1Q9 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
VarsQ9Z1Q9 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
VarsQ9Z1Q9 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
VarsQ9Z1Q9 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
VarsQ9Z1Q9 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
VarsQ9Z1Q9 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
VarsQ9Z1Q9 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
VarsQ9Z1Q9 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
VarsQ9Z1Q9 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
VarsQ9Z1Q9 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
VarsQ9Z1Q9 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
VarsQ9Z1Q9 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
VarsQ9Z1Q9 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
VarsQ9Z1Q9 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
VarsQ9Z1Q9 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.5 ms