Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1L5

Cacna2d3, Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2/delta-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,091 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna2d3Q9Z1L5 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cacna2d3Q9Z1L5 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cacna2d3Q9Z1L5 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cacna2d3Q9Z1L5 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cacna2d3Q9Z1L5 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cacna2d3Q9Z1L5 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cacna2d3Q9Z1L5 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cacna2d3Q9Z1L5 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cacna2d3Q9Z1L5 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cacna2d3Q9Z1L5 Dido1-202ENSMUST00000087517 8723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cacna2d3Q9Z1L5 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cacna2d3Q9Z1L5 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cacna2d3Q9Z1L5 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cacna2d3Q9Z1L5 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cacna2d3Q9Z1L5 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cacna2d3Q9Z1L5 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cacna2d3Q9Z1L5 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cacna2d3Q9Z1L5 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cacna2d3Q9Z1L5 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cacna2d3Q9Z1L5 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cacna2d3Q9Z1L5 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cacna2d3Q9Z1L5 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cacna2d3Q9Z1L5 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cacna2d3Q9Z1L5 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cacna2d3Q9Z1L5 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cacna2d3Q9Z1L5 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cacna2d3Q9Z1L5 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cacna2d3Q9Z1L5 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cacna2d3Q9Z1L5 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cacna2d3Q9Z1L5 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cacna2d3Q9Z1L5 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cacna2d3Q9Z1L5 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cacna2d3Q9Z1L5 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cacna2d3Q9Z1L5 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cacna2d3Q9Z1L5 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cacna2d3Q9Z1L5 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cacna2d3Q9Z1L5 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cacna2d3Q9Z1L5 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cacna2d3Q9Z1L5 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cacna2d3Q9Z1L5 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cacna2d3Q9Z1L5 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cacna2d3Q9Z1L5 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cacna2d3Q9Z1L5 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Cacna2d3Q9Z1L5 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Cacna2d3Q9Z1L5 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cacna2d3Q9Z1L5 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cacna2d3Q9Z1L5 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Cacna2d3Q9Z1L5 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cacna2d3Q9Z1L5 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Cacna2d3Q9Z1L5 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cacna2d3Q9Z1L5 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cacna2d3Q9Z1L5 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cacna2d3Q9Z1L5 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cacna2d3Q9Z1L5 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cacna2d3Q9Z1L5 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cacna2d3Q9Z1L5 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cacna2d3Q9Z1L5 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cacna2d3Q9Z1L5 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cacna2d3Q9Z1L5 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cacna2d3Q9Z1L5 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Cacna2d3Q9Z1L5 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cacna2d3Q9Z1L5 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cacna2d3Q9Z1L5 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cacna2d3Q9Z1L5 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cacna2d3Q9Z1L5 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cacna2d3Q9Z1L5 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Cacna2d3Q9Z1L5 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cacna2d3Q9Z1L5 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cacna2d3Q9Z1L5 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cacna2d3Q9Z1L5 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cacna2d3Q9Z1L5 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cacna2d3Q9Z1L5 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cacna2d3Q9Z1L5 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cacna2d3Q9Z1L5 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cacna2d3Q9Z1L5 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cacna2d3Q9Z1L5 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cacna2d3Q9Z1L5 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cacna2d3Q9Z1L5 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cacna2d3Q9Z1L5 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cacna2d3Q9Z1L5 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cacna2d3Q9Z1L5 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Cacna2d3Q9Z1L5 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cacna2d3Q9Z1L5 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cacna2d3Q9Z1L5 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cacna2d3Q9Z1L5 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cacna2d3Q9Z1L5 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cacna2d3Q9Z1L5 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cacna2d3Q9Z1L5 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cacna2d3Q9Z1L5 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cacna2d3Q9Z1L5 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cacna2d3Q9Z1L5 Nav1-207ENSMUST00000190298 8557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.9 ms