Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z179

Shcbp1, SHC SH2 domain-binding protein 1, mousemouse

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Length 668 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shcbp1Q9Z179 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Shcbp1Q9Z179 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Shcbp1Q9Z179 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Shcbp1Q9Z179 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Shcbp1Q9Z179 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Shcbp1Q9Z179 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Shcbp1Q9Z179 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Shcbp1Q9Z179 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Shcbp1Q9Z179 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Shcbp1Q9Z179 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Shcbp1Q9Z179 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Shcbp1Q9Z179 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Shcbp1Q9Z179 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Shcbp1Q9Z179 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Shcbp1Q9Z179 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Shcbp1Q9Z179 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Shcbp1Q9Z179 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Shcbp1Q9Z179 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Shcbp1Q9Z179 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Shcbp1Q9Z179 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Shcbp1Q9Z179 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Shcbp1Q9Z179 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Shcbp1Q9Z179 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Shcbp1Q9Z179 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Shcbp1Q9Z179 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Shcbp1Q9Z179 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Shcbp1Q9Z179 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Shcbp1Q9Z179 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Shcbp1Q9Z179 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Shcbp1Q9Z179 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Shcbp1Q9Z179 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Shcbp1Q9Z179 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Shcbp1Q9Z179 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Shcbp1Q9Z179 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Shcbp1Q9Z179 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Shcbp1Q9Z179 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Shcbp1Q9Z179 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Shcbp1Q9Z179 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Shcbp1Q9Z179 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Shcbp1Q9Z179 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Shcbp1Q9Z179 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Shcbp1Q9Z179 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Shcbp1Q9Z179 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Shcbp1Q9Z179 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Shcbp1Q9Z179 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Shcbp1Q9Z179 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Shcbp1Q9Z179 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Shcbp1Q9Z179 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Shcbp1Q9Z179 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Shcbp1Q9Z179 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Shcbp1Q9Z179 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Shcbp1Q9Z179 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Shcbp1Q9Z179 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Shcbp1Q9Z179 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Shcbp1Q9Z179 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Shcbp1Q9Z179 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Shcbp1Q9Z179 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Shcbp1Q9Z179 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Shcbp1Q9Z179 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Shcbp1Q9Z179 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Shcbp1Q9Z179 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Shcbp1Q9Z179 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Shcbp1Q9Z179 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Shcbp1Q9Z179 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Shcbp1Q9Z179 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Shcbp1Q9Z179 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Shcbp1Q9Z179 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Shcbp1Q9Z179 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Shcbp1Q9Z179 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Shcbp1Q9Z179 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Shcbp1Q9Z179 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Shcbp1Q9Z179 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Shcbp1Q9Z179 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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