Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z172

Sumo3, Small ubiquitin-related modifier 3, mousemouse

Predictions only

Length 110 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sumo3Q9Z172 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Sumo3Q9Z172 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Sumo3Q9Z172 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Sumo3Q9Z172 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Sumo3Q9Z172 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Sumo3Q9Z172 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Sumo3Q9Z172 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Sumo3Q9Z172 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Sumo3Q9Z172 Gm5422-201ENSMUST00000050717 2721 ntBASIC12.15□□□□□ -0.47
Sumo3Q9Z172 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
Sumo3Q9Z172 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC12.15□□□□□ -0.47
Sumo3Q9Z172 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Sumo3Q9Z172 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Sumo3Q9Z172 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Sumo3Q9Z172 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Sumo3Q9Z172 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Sumo3Q9Z172 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Sumo3Q9Z172 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Sumo3Q9Z172 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Sumo3Q9Z172 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Sumo3Q9Z172 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Sumo3Q9Z172 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Sumo3Q9Z172 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Sumo3Q9Z172 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Sumo3Q9Z172 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Sumo3Q9Z172 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Sumo3Q9Z172 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Sumo3Q9Z172 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Sumo3Q9Z172 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Sumo3Q9Z172 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Sumo3Q9Z172 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Sumo3Q9Z172 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Sumo3Q9Z172 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Sumo3Q9Z172 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Sumo3Q9Z172 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Sumo3Q9Z172 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Sumo3Q9Z172 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Sumo3Q9Z172 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Sumo3Q9Z172 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Sumo3Q9Z172 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Sumo3Q9Z172 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Sumo3Q9Z172 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Sumo3Q9Z172 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Sumo3Q9Z172 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Sumo3Q9Z172 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Sumo3Q9Z172 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Sumo3Q9Z172 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Sumo3Q9Z172 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Sumo3Q9Z172 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Sumo3Q9Z172 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Sumo3Q9Z172 Gm13615-201ENSMUST00000120242 1612 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Sumo3Q9Z172 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Sumo3Q9Z172 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Sumo3Q9Z172 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Sumo3Q9Z172 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Sumo3Q9Z172 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Sumo3Q9Z172 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Sumo3Q9Z172 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Sumo3Q9Z172 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Sumo3Q9Z172 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Sumo3Q9Z172 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Sumo3Q9Z172 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Sumo3Q9Z172 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Sumo3Q9Z172 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Sumo3Q9Z172 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Sumo3Q9Z172 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Sumo3Q9Z172 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Sumo3Q9Z172 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Sumo3Q9Z172 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Sumo3Q9Z172 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Sumo3Q9Z172 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Sumo3Q9Z172 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Sumo3Q9Z172 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Sumo3Q9Z172 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Sumo3Q9Z172 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Sumo3Q9Z172 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Sumo3Q9Z172 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Sumo3Q9Z172 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Sumo3Q9Z172 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Sumo3Q9Z172 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Sumo3Q9Z172 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Sumo3Q9Z172 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Sumo3Q9Z172 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Sumo3Q9Z172 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Sumo3Q9Z172 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Sumo3Q9Z172 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Sumo3Q9Z172 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Sumo3Q9Z172 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Sumo3Q9Z172 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Sumo3Q9Z172 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Sumo3Q9Z172 Gm43936-201ENSMUST00000203987 490 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Sumo3Q9Z172 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Sumo3Q9Z172 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Sumo3Q9Z172 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Sumo3Q9Z172 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Sumo3Q9Z172 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Sumo3Q9Z172 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Sumo3Q9Z172 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Sumo3Q9Z172 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Sumo3Q9Z172 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms