Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0W3

Nup160, Nuclear pore complex protein Nup160, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,402 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup160Q9Z0W3 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nup160Q9Z0W3 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nup160Q9Z0W3 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nup160Q9Z0W3 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nup160Q9Z0W3 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nup160Q9Z0W3 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nup160Q9Z0W3 Gm34549-203ENSMUST00000208300 896 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nup160Q9Z0W3 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nup160Q9Z0W3 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nup160Q9Z0W3 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nup160Q9Z0W3 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nup160Q9Z0W3 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nup160Q9Z0W3 Mfsd4b5-205ENSMUST00000170579 1554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nup160Q9Z0W3 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nup160Q9Z0W3 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nup160Q9Z0W3 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nup160Q9Z0W3 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nup160Q9Z0W3 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nup160Q9Z0W3 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nup160Q9Z0W3 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nup160Q9Z0W3 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nup160Q9Z0W3 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nup160Q9Z0W3 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nup160Q9Z0W3 Fundc1-204ENSMUST00000176638 448 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nup160Q9Z0W3 Gm37312-201ENSMUST00000195753 685 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nup160Q9Z0W3 Gm44364-201ENSMUST00000198368 141 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Nup160Q9Z0W3 Gm45865-201ENSMUST00000211815 945 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Nup160Q9Z0W3 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nup160Q9Z0W3 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nup160Q9Z0W3 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nup160Q9Z0W3 Tmem80-204ENSMUST00000128906 1387 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nup160Q9Z0W3 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nup160Q9Z0W3 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nup160Q9Z0W3 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nup160Q9Z0W3 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nup160Q9Z0W3 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nup160Q9Z0W3 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nup160Q9Z0W3 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nup160Q9Z0W3 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nup160Q9Z0W3 Rwdd3-209ENSMUST00000170781 1111 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nup160Q9Z0W3 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Nup160Q9Z0W3 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nup160Q9Z0W3 Gm6169-201ENSMUST00000071118 1030 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nup160Q9Z0W3 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nup160Q9Z0W3 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nup160Q9Z0W3 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nup160Q9Z0W3 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nup160Q9Z0W3 Pole3-201ENSMUST00000030091 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nup160Q9Z0W3 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nup160Q9Z0W3 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nup160Q9Z0W3 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nup160Q9Z0W3 Mir877-201ENSMUST00000104738 85 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Nup160Q9Z0W3 Gm12176-201ENSMUST00000121420 875 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Nup160Q9Z0W3 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nup160Q9Z0W3 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nup160Q9Z0W3 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nup160Q9Z0W3 Mea1-201ENSMUST00000002845 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nup160Q9Z0W3 Ccs-201ENSMUST00000037246 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nup160Q9Z0W3 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nup160Q9Z0W3 Nr0b2-201ENSMUST00000042706 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nup160Q9Z0W3 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nup160Q9Z0W3 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nup160Q9Z0W3 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nup160Q9Z0W3 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nup160Q9Z0W3 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nup160Q9Z0W3 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nup160Q9Z0W3 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nup160Q9Z0W3 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nup160Q9Z0W3 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nup160Q9Z0W3 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nup160Q9Z0W3 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Nup160Q9Z0W3 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Nup160Q9Z0W3 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Nup160Q9Z0W3 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Nup160Q9Z0W3 Gm6203-201ENSMUST00000209575 1342 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Nup160Q9Z0W3 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Nup160Q9Z0W3 Gm13786-201ENSMUST00000122371 333 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Nup160Q9Z0W3 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Nup160Q9Z0W3 C030047K22Rik-201ENSMUST00000150382 1164 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Nup160Q9Z0W3 Gm7029-201ENSMUST00000173226 450 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Nup160Q9Z0W3 Mir5132-201ENSMUST00000175166 71 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Nup160Q9Z0W3 Gm29396-201ENSMUST00000185659 716 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Nup160Q9Z0W3 AC164573.1-201ENSMUST00000218616 963 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Nup160Q9Z0W3 Ddit3-201ENSMUST00000026475 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Nup160Q9Z0W3 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Nup160Q9Z0W3 Rhox2a-201ENSMUST00000063340 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Nup160Q9Z0W3 Olfr521-201ENSMUST00000098263 967 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Nup160Q9Z0W3 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Nup160Q9Z0W3 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Nup160Q9Z0W3 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Nup160Q9Z0W3 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Nup160Q9Z0W3 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Nup160Q9Z0W3 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Nup160Q9Z0W3 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Nup160Q9Z0W3 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Nup160Q9Z0W3 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Nup160Q9Z0W3 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Nup160Q9Z0W3 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Nup160Q9Z0W3 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Nup160Q9Z0W3 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.4 ms