Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0S4

Cldn13, Claudin-13, mousemouse

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Length 211 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn13Q9Z0S4 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Cldn13Q9Z0S4 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cldn13Q9Z0S4 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cldn13Q9Z0S4 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cldn13Q9Z0S4 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cldn13Q9Z0S4 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cldn13Q9Z0S4 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cldn13Q9Z0S4 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cldn13Q9Z0S4 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cldn13Q9Z0S4 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cldn13Q9Z0S4 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Cldn13Q9Z0S4 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cldn13Q9Z0S4 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cldn13Q9Z0S4 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cldn13Q9Z0S4 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cldn13Q9Z0S4 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cldn13Q9Z0S4 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cldn13Q9Z0S4 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Cldn13Q9Z0S4 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cldn13Q9Z0S4 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cldn13Q9Z0S4 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Cldn13Q9Z0S4 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cldn13Q9Z0S4 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Cldn13Q9Z0S4 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cldn13Q9Z0S4 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Cldn13Q9Z0S4 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Cldn13Q9Z0S4 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cldn13Q9Z0S4 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cldn13Q9Z0S4 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cldn13Q9Z0S4 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cldn13Q9Z0S4 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Cldn13Q9Z0S4 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Cldn13Q9Z0S4 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Cldn13Q9Z0S4 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cldn13Q9Z0S4 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cldn13Q9Z0S4 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cldn13Q9Z0S4 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cldn13Q9Z0S4 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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Cldn13Q9Z0S4 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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Cldn13Q9Z0S4 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cldn13Q9Z0S4 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cldn13Q9Z0S4 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cldn13Q9Z0S4 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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Cldn13Q9Z0S4 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cldn13Q9Z0S4 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cldn13Q9Z0S4 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cldn13Q9Z0S4 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cldn13Q9Z0S4 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cldn13Q9Z0S4 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cldn13Q9Z0S4 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cldn13Q9Z0S4 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cldn13Q9Z0S4 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cldn13Q9Z0S4 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cldn13Q9Z0S4 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cldn13Q9Z0S4 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cldn13Q9Z0S4 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cldn13Q9Z0S4 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cldn13Q9Z0S4 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cldn13Q9Z0S4 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cldn13Q9Z0S4 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cldn13Q9Z0S4 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cldn13Q9Z0S4 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cldn13Q9Z0S4 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cldn13Q9Z0S4 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cldn13Q9Z0S4 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cldn13Q9Z0S4 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cldn13Q9Z0S4 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Cldn13Q9Z0S4 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cldn13Q9Z0S4 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cldn13Q9Z0S4 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cldn13Q9Z0S4 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cldn13Q9Z0S4 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
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