Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0G9

Cldn3, Claudin-3, mousemouse

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Length 219 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn3Q9Z0G9 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
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Cldn3Q9Z0G9 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
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Cldn3Q9Z0G9 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cldn3Q9Z0G9 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
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Cldn3Q9Z0G9 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cldn3Q9Z0G9 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cldn3Q9Z0G9 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
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Cldn3Q9Z0G9 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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Cldn3Q9Z0G9 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cldn3Q9Z0G9 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cldn3Q9Z0G9 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Cldn3Q9Z0G9 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Cldn3Q9Z0G9 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
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Cldn3Q9Z0G9 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
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Cldn3Q9Z0G9 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
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Cldn3Q9Z0G9 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cldn3Q9Z0G9 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cldn3Q9Z0G9 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
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Cldn3Q9Z0G9 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cldn3Q9Z0G9 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cldn3Q9Z0G9 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
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Cldn3Q9Z0G9 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cldn3Q9Z0G9 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cldn3Q9Z0G9 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
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Cldn3Q9Z0G9 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cldn3Q9Z0G9 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cldn3Q9Z0G9 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cldn3Q9Z0G9 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cldn3Q9Z0G9 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
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Cldn3Q9Z0G9 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
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Cldn3Q9Z0G9 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cldn3Q9Z0G9 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cldn3Q9Z0G9 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cldn3Q9Z0G9 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
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Cldn3Q9Z0G9 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cldn3Q9Z0G9 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cldn3Q9Z0G9 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cldn3Q9Z0G9 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cldn3Q9Z0G9 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cldn3Q9Z0G9 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cldn3Q9Z0G9 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cldn3Q9Z0G9 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cldn3Q9Z0G9 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cldn3Q9Z0G9 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cldn3Q9Z0G9 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cldn3Q9Z0G9 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cldn3Q9Z0G9 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cldn3Q9Z0G9 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Cldn3Q9Z0G9 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cldn3Q9Z0G9 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cldn3Q9Z0G9 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Cldn3Q9Z0G9 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cldn3Q9Z0G9 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
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