Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0E6

Gbp2, Guanylate-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 589 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbp2Q9Z0E6 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gbp2Q9Z0E6 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gbp2Q9Z0E6 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
Gbp2Q9Z0E6 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gbp2Q9Z0E6 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gbp2Q9Z0E6 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gbp2Q9Z0E6 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gbp2Q9Z0E6 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gbp2Q9Z0E6 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gbp2Q9Z0E6 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gbp2Q9Z0E6 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Gbp2Q9Z0E6 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gbp2Q9Z0E6 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gbp2Q9Z0E6 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gbp2Q9Z0E6 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gbp2Q9Z0E6 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Gbp2Q9Z0E6 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gbp2Q9Z0E6 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gbp2Q9Z0E6 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gbp2Q9Z0E6 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gbp2Q9Z0E6 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Gbp2Q9Z0E6 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gbp2Q9Z0E6 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gbp2Q9Z0E6 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gbp2Q9Z0E6 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gbp2Q9Z0E6 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gbp2Q9Z0E6 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gbp2Q9Z0E6 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gbp2Q9Z0E6 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gbp2Q9Z0E6 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gbp2Q9Z0E6 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gbp2Q9Z0E6 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gbp2Q9Z0E6 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Gbp2Q9Z0E6 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gbp2Q9Z0E6 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gbp2Q9Z0E6 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gbp2Q9Z0E6 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gbp2Q9Z0E6 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gbp2Q9Z0E6 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gbp2Q9Z0E6 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gbp2Q9Z0E6 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gbp2Q9Z0E6 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gbp2Q9Z0E6 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gbp2Q9Z0E6 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Gbp2Q9Z0E6 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Gbp2Q9Z0E6 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gbp2Q9Z0E6 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gbp2Q9Z0E6 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gbp2Q9Z0E6 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gbp2Q9Z0E6 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gbp2Q9Z0E6 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Gbp2Q9Z0E6 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gbp2Q9Z0E6 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gbp2Q9Z0E6 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gbp2Q9Z0E6 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gbp2Q9Z0E6 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gbp2Q9Z0E6 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gbp2Q9Z0E6 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gbp2Q9Z0E6 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gbp2Q9Z0E6 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gbp2Q9Z0E6 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gbp2Q9Z0E6 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gbp2Q9Z0E6 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gbp2Q9Z0E6 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gbp2Q9Z0E6 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gbp2Q9Z0E6 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gbp2Q9Z0E6 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gbp2Q9Z0E6 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gbp2Q9Z0E6 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gbp2Q9Z0E6 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gbp2Q9Z0E6 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gbp2Q9Z0E6 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gbp2Q9Z0E6 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gbp2Q9Z0E6 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gbp2Q9Z0E6 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gbp2Q9Z0E6 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gbp2Q9Z0E6 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gbp2Q9Z0E6 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gbp2Q9Z0E6 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gbp2Q9Z0E6 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gbp2Q9Z0E6 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gbp2Q9Z0E6 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gbp2Q9Z0E6 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gbp2Q9Z0E6 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gbp2Q9Z0E6 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gbp2Q9Z0E6 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gbp2Q9Z0E6 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gbp2Q9Z0E6 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gbp2Q9Z0E6 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gbp2Q9Z0E6 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gbp2Q9Z0E6 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gbp2Q9Z0E6 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gbp2Q9Z0E6 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Gbp2Q9Z0E6 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gbp2Q9Z0E6 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gbp2Q9Z0E6 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gbp2Q9Z0E6 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gbp2Q9Z0E6 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gbp2Q9Z0E6 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gbp2Q9Z0E6 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms