Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0E3

Aire, Autoimmune regulator, mousemouse

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Length 552 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AireQ9Z0E3 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
AireQ9Z0E3 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
AireQ9Z0E3 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
AireQ9Z0E3 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
AireQ9Z0E3 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
AireQ9Z0E3 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
AireQ9Z0E3 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
AireQ9Z0E3 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC13.18□□□□□ -0.3
AireQ9Z0E3 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
AireQ9Z0E3 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
AireQ9Z0E3 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
AireQ9Z0E3 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
AireQ9Z0E3 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
AireQ9Z0E3 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
AireQ9Z0E3 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
AireQ9Z0E3 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
AireQ9Z0E3 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
AireQ9Z0E3 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC13.17□□□□□ -0.3
AireQ9Z0E3 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
AireQ9Z0E3 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
AireQ9Z0E3 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
AireQ9Z0E3 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC13.17□□□□□ -0.3
AireQ9Z0E3 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
AireQ9Z0E3 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
AireQ9Z0E3 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
AireQ9Z0E3 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
AireQ9Z0E3 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
AireQ9Z0E3 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
AireQ9Z0E3 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
AireQ9Z0E3 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
AireQ9Z0E3 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
AireQ9Z0E3 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
AireQ9Z0E3 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
AireQ9Z0E3 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
AireQ9Z0E3 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
AireQ9Z0E3 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
AireQ9Z0E3 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC13.17□□□□□ -0.3
AireQ9Z0E3 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
AireQ9Z0E3 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
AireQ9Z0E3 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
AireQ9Z0E3 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
AireQ9Z0E3 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
AireQ9Z0E3 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
AireQ9Z0E3 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
AireQ9Z0E3 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
AireQ9Z0E3 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
AireQ9Z0E3 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
AireQ9Z0E3 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
AireQ9Z0E3 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
AireQ9Z0E3 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
AireQ9Z0E3 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
AireQ9Z0E3 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
AireQ9Z0E3 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
AireQ9Z0E3 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
AireQ9Z0E3 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
AireQ9Z0E3 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
AireQ9Z0E3 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
AireQ9Z0E3 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
AireQ9Z0E3 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
AireQ9Z0E3 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
AireQ9Z0E3 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
AireQ9Z0E3 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
AireQ9Z0E3 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
AireQ9Z0E3 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
AireQ9Z0E3 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
AireQ9Z0E3 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
AireQ9Z0E3 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
AireQ9Z0E3 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
AireQ9Z0E3 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
AireQ9Z0E3 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
AireQ9Z0E3 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
AireQ9Z0E3 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
AireQ9Z0E3 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
AireQ9Z0E3 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
AireQ9Z0E3 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
AireQ9Z0E3 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
AireQ9Z0E3 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
AireQ9Z0E3 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
AireQ9Z0E3 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
AireQ9Z0E3 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
AireQ9Z0E3 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
AireQ9Z0E3 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
AireQ9Z0E3 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
AireQ9Z0E3 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
AireQ9Z0E3 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
AireQ9Z0E3 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
AireQ9Z0E3 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
AireQ9Z0E3 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
AireQ9Z0E3 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
AireQ9Z0E3 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
AireQ9Z0E3 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
AireQ9Z0E3 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
AireQ9Z0E3 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
AireQ9Z0E3 Mypopos-202ENSMUST00000205975 2321 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
AireQ9Z0E3 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
AireQ9Z0E3 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
AireQ9Z0E3 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
AireQ9Z0E3 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
AireQ9Z0E3 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
AireQ9Z0E3 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
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