Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV89

Stxbp4, Syntaxin-binding protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stxbp4Q9WV89 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Stxbp4Q9WV89 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Stxbp4Q9WV89 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Stxbp4Q9WV89 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Stxbp4Q9WV89 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Stxbp4Q9WV89 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Stxbp4Q9WV89 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Stxbp4Q9WV89 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Stxbp4Q9WV89 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Stxbp4Q9WV89 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Stxbp4Q9WV89 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Stxbp4Q9WV89 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Stxbp4Q9WV89 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Stxbp4Q9WV89 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Stxbp4Q9WV89 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Stxbp4Q9WV89 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Stxbp4Q9WV89 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Stxbp4Q9WV89 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Stxbp4Q9WV89 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Stxbp4Q9WV89 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Stxbp4Q9WV89 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Stxbp4Q9WV89 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Stxbp4Q9WV89 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Stxbp4Q9WV89 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Stxbp4Q9WV89 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Stxbp4Q9WV89 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Stxbp4Q9WV89 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Stxbp4Q9WV89 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Stxbp4Q9WV89 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Stxbp4Q9WV89 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Stxbp4Q9WV89 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Stxbp4Q9WV89 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Stxbp4Q9WV89 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Stxbp4Q9WV89 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Stxbp4Q9WV89 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Stxbp4Q9WV89 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Stxbp4Q9WV89 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Stxbp4Q9WV89 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Stxbp4Q9WV89 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Stxbp4Q9WV89 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Stxbp4Q9WV89 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Stxbp4Q9WV89 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Stxbp4Q9WV89 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Stxbp4Q9WV89 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Stxbp4Q9WV89 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Stxbp4Q9WV89 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Stxbp4Q9WV89 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Stxbp4Q9WV89 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Stxbp4Q9WV89 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Stxbp4Q9WV89 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Stxbp4Q9WV89 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Stxbp4Q9WV89 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Stxbp4Q9WV89 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Stxbp4Q9WV89 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Stxbp4Q9WV89 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Stxbp4Q9WV89 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Stxbp4Q9WV89 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Stxbp4Q9WV89 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Stxbp4Q9WV89 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Stxbp4Q9WV89 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Stxbp4Q9WV89 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Stxbp4Q9WV89 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Stxbp4Q9WV89 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Stxbp4Q9WV89 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Stxbp4Q9WV89 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Stxbp4Q9WV89 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Stxbp4Q9WV89 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Stxbp4Q9WV89 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Stxbp4Q9WV89 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Stxbp4Q9WV89 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Stxbp4Q9WV89 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Stxbp4Q9WV89 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Stxbp4Q9WV89 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Stxbp4Q9WV89 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Stxbp4Q9WV89 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Stxbp4Q9WV89 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Stxbp4Q9WV89 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Stxbp4Q9WV89 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Stxbp4Q9WV89 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Stxbp4Q9WV89 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Stxbp4Q9WV89 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Stxbp4Q9WV89 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Stxbp4Q9WV89 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Stxbp4Q9WV89 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Stxbp4Q9WV89 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Stxbp4Q9WV89 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Stxbp4Q9WV89 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Stxbp4Q9WV89 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Stxbp4Q9WV89 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Stxbp4Q9WV89 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Stxbp4Q9WV89 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Stxbp4Q9WV89 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Stxbp4Q9WV89 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Stxbp4Q9WV89 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Stxbp4Q9WV89 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Stxbp4Q9WV89 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Stxbp4Q9WV89 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Stxbp4Q9WV89 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Stxbp4Q9WV89 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Stxbp4Q9WV89 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.2 ms