Protein–RNA interactions for Protein: Q9WUZ5

Tnni1, Troponin I, slow skeletal muscle, mousemouse

Predictions only

Length 187 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnni1Q9WUZ5 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tnni1Q9WUZ5 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tnni1Q9WUZ5 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tnni1Q9WUZ5 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tnni1Q9WUZ5 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tnni1Q9WUZ5 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tnni1Q9WUZ5 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tnni1Q9WUZ5 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tnni1Q9WUZ5 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tnni1Q9WUZ5 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tnni1Q9WUZ5 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tnni1Q9WUZ5 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tnni1Q9WUZ5 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tnni1Q9WUZ5 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tnni1Q9WUZ5 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tnni1Q9WUZ5 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tnni1Q9WUZ5 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tnni1Q9WUZ5 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tnni1Q9WUZ5 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tnni1Q9WUZ5 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tnni1Q9WUZ5 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tnni1Q9WUZ5 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tnni1Q9WUZ5 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tnni1Q9WUZ5 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tnni1Q9WUZ5 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tnni1Q9WUZ5 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tnni1Q9WUZ5 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tnni1Q9WUZ5 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tnni1Q9WUZ5 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tnni1Q9WUZ5 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tnni1Q9WUZ5 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Tnni1Q9WUZ5 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tnni1Q9WUZ5 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tnni1Q9WUZ5 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tnni1Q9WUZ5 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Tnni1Q9WUZ5 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tnni1Q9WUZ5 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tnni1Q9WUZ5 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tnni1Q9WUZ5 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tnni1Q9WUZ5 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tnni1Q9WUZ5 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tnni1Q9WUZ5 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tnni1Q9WUZ5 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tnni1Q9WUZ5 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tnni1Q9WUZ5 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tnni1Q9WUZ5 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tnni1Q9WUZ5 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tnni1Q9WUZ5 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tnni1Q9WUZ5 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tnni1Q9WUZ5 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tnni1Q9WUZ5 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tnni1Q9WUZ5 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tnni1Q9WUZ5 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tnni1Q9WUZ5 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tnni1Q9WUZ5 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tnni1Q9WUZ5 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tnni1Q9WUZ5 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tnni1Q9WUZ5 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tnni1Q9WUZ5 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tnni1Q9WUZ5 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Tnni1Q9WUZ5 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Tnni1Q9WUZ5 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Tnni1Q9WUZ5 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Tnni1Q9WUZ5 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tnni1Q9WUZ5 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tnni1Q9WUZ5 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tnni1Q9WUZ5 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tnni1Q9WUZ5 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tnni1Q9WUZ5 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tnni1Q9WUZ5 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tnni1Q9WUZ5 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tnni1Q9WUZ5 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tnni1Q9WUZ5 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tnni1Q9WUZ5 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tnni1Q9WUZ5 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tnni1Q9WUZ5 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tnni1Q9WUZ5 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tnni1Q9WUZ5 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Tnni1Q9WUZ5 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tnni1Q9WUZ5 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tnni1Q9WUZ5 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tnni1Q9WUZ5 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tnni1Q9WUZ5 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tnni1Q9WUZ5 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tnni1Q9WUZ5 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Tnni1Q9WUZ5 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tnni1Q9WUZ5 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tnni1Q9WUZ5 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tnni1Q9WUZ5 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tnni1Q9WUZ5 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tnni1Q9WUZ5 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tnni1Q9WUZ5 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tnni1Q9WUZ5 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tnni1Q9WUZ5 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tnni1Q9WUZ5 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tnni1Q9WUZ5 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Tnni1Q9WUZ5 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tnni1Q9WUZ5 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tnni1Q9WUZ5 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tnni1Q9WUZ5 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms