Protein–RNA interactions for Protein: Q9WUU8

Tnip1, TNFAIP3-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 647 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnip1Q9WUU8 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tnip1Q9WUU8 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tnip1Q9WUU8 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tnip1Q9WUU8 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tnip1Q9WUU8 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tnip1Q9WUU8 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Tnip1Q9WUU8 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tnip1Q9WUU8 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tnip1Q9WUU8 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tnip1Q9WUU8 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tnip1Q9WUU8 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tnip1Q9WUU8 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tnip1Q9WUU8 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tnip1Q9WUU8 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Tnip1Q9WUU8 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Tnip1Q9WUU8 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tnip1Q9WUU8 Gas5-210ENSMUST00000159706 557 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tnip1Q9WUU8 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Tnip1Q9WUU8 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tnip1Q9WUU8 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tnip1Q9WUU8 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tnip1Q9WUU8 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tnip1Q9WUU8 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tnip1Q9WUU8 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tnip1Q9WUU8 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tnip1Q9WUU8 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tnip1Q9WUU8 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tnip1Q9WUU8 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tnip1Q9WUU8 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tnip1Q9WUU8 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tnip1Q9WUU8 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tnip1Q9WUU8 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tnip1Q9WUU8 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tnip1Q9WUU8 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tnip1Q9WUU8 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tnip1Q9WUU8 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tnip1Q9WUU8 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tnip1Q9WUU8 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tnip1Q9WUU8 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tnip1Q9WUU8 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tnip1Q9WUU8 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tnip1Q9WUU8 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tnip1Q9WUU8 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tnip1Q9WUU8 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Tnip1Q9WUU8 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tnip1Q9WUU8 Gm14285-201ENSMUST00000146049 380 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tnip1Q9WUU8 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tnip1Q9WUU8 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tnip1Q9WUU8 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tnip1Q9WUU8 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tnip1Q9WUU8 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Tnip1Q9WUU8 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tnip1Q9WUU8 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tnip1Q9WUU8 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tnip1Q9WUU8 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tnip1Q9WUU8 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tnip1Q9WUU8 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tnip1Q9WUU8 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tnip1Q9WUU8 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tnip1Q9WUU8 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tnip1Q9WUU8 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tnip1Q9WUU8 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tnip1Q9WUU8 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tnip1Q9WUU8 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tnip1Q9WUU8 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tnip1Q9WUU8 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tnip1Q9WUU8 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tnip1Q9WUU8 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tnip1Q9WUU8 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Tnip1Q9WUU8 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Tnip1Q9WUU8 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Tnip1Q9WUU8 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Tnip1Q9WUU8 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Tnip1Q9WUU8 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tnip1Q9WUU8 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tnip1Q9WUU8 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Tnip1Q9WUU8 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Tnip1Q9WUU8 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tnip1Q9WUU8 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tnip1Q9WUU8 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tnip1Q9WUU8 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tnip1Q9WUU8 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tnip1Q9WUU8 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tnip1Q9WUU8 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tnip1Q9WUU8 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tnip1Q9WUU8 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tnip1Q9WUU8 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tnip1Q9WUU8 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tnip1Q9WUU8 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tnip1Q9WUU8 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tnip1Q9WUU8 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tnip1Q9WUU8 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tnip1Q9WUU8 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tnip1Q9WUU8 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tnip1Q9WUU8 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tnip1Q9WUU8 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Tnip1Q9WUU8 Gm11425-201ENSMUST00000119608 498 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Tnip1Q9WUU8 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tnip1Q9WUU8 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tnip1Q9WUU8 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms