Protein–RNA interactions for Protein: Q9WUH5

Trim10, Tripartite motif-containing protein 10, mousemouse

Predictions only

Length 489 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim10Q9WUH5 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Trim10Q9WUH5 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Trim10Q9WUH5 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Trim10Q9WUH5 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Trim10Q9WUH5 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Trim10Q9WUH5 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Trim10Q9WUH5 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Trim10Q9WUH5 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Trim10Q9WUH5 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Trim10Q9WUH5 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Trim10Q9WUH5 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Trim10Q9WUH5 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Trim10Q9WUH5 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Trim10Q9WUH5 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Trim10Q9WUH5 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Trim10Q9WUH5 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC15.64■□□□□ 0.1
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Trim10Q9WUH5 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trim10Q9WUH5 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trim10Q9WUH5 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trim10Q9WUH5 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trim10Q9WUH5 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trim10Q9WUH5 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trim10Q9WUH5 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trim10Q9WUH5 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trim10Q9WUH5 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Trim10Q9WUH5 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trim10Q9WUH5 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trim10Q9WUH5 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trim10Q9WUH5 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trim10Q9WUH5 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trim10Q9WUH5 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trim10Q9WUH5 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trim10Q9WUH5 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trim10Q9WUH5 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trim10Q9WUH5 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trim10Q9WUH5 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trim10Q9WUH5 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trim10Q9WUH5 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trim10Q9WUH5 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trim10Q9WUH5 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trim10Q9WUH5 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trim10Q9WUH5 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trim10Q9WUH5 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trim10Q9WUH5 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trim10Q9WUH5 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trim10Q9WUH5 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trim10Q9WUH5 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trim10Q9WUH5 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Trim10Q9WUH5 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trim10Q9WUH5 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trim10Q9WUH5 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trim10Q9WUH5 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trim10Q9WUH5 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trim10Q9WUH5 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trim10Q9WUH5 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trim10Q9WUH5 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trim10Q9WUH5 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trim10Q9WUH5 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trim10Q9WUH5 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trim10Q9WUH5 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trim10Q9WUH5 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Trim10Q9WUH5 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
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Trim10Q9WUH5 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
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Trim10Q9WUH5 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trim10Q9WUH5 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trim10Q9WUH5 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trim10Q9WUH5 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trim10Q9WUH5 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trim10Q9WUH5 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trim10Q9WUH5 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim10Q9WUH5 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim10Q9WUH5 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim10Q9WUH5 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim10Q9WUH5 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim10Q9WUH5 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim10Q9WUH5 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim10Q9WUH5 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim10Q9WUH5 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim10Q9WUH5 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim10Q9WUH5 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim10Q9WUH5 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim10Q9WUH5 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim10Q9WUH5 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim10Q9WUH5 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim10Q9WUH5 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim10Q9WUH5 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim10Q9WUH5 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim10Q9WUH5 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim10Q9WUH5 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim10Q9WUH5 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim10Q9WUH5 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim10Q9WUH5 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.2 ms