Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0Q8

Clec4e, C-type lectin domain family 4 member E, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clec4eQ9R0Q8 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
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Clec4eQ9R0Q8 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
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Clec4eQ9R0Q8 Kdm5c-203ENSMUST00000112588 6449 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
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Clec4eQ9R0Q8 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
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Clec4eQ9R0Q8 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
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Clec4eQ9R0Q8 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
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Clec4eQ9R0Q8 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Clec4eQ9R0Q8 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
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Clec4eQ9R0Q8 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
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Clec4eQ9R0Q8 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Clec4eQ9R0Q8 Zeb2-211ENSMUST00000153561 2070 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Clec4eQ9R0Q8 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Clec4eQ9R0Q8 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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Clec4eQ9R0Q8 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Clec4eQ9R0Q8 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Clec4eQ9R0Q8 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Clec4eQ9R0Q8 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Clec4eQ9R0Q8 2610011E03Rik-201ENSMUST00000200128 2235 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Clec4eQ9R0Q8 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Clec4eQ9R0Q8 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Clec4eQ9R0Q8 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Clec4eQ9R0Q8 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Clec4eQ9R0Q8 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Clec4eQ9R0Q8 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Clec4eQ9R0Q8 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Clec4eQ9R0Q8 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Clec4eQ9R0Q8 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Clec4eQ9R0Q8 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Clec4eQ9R0Q8 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Clec4eQ9R0Q8 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Clec4eQ9R0Q8 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Clec4eQ9R0Q8 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Clec4eQ9R0Q8 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Clec4eQ9R0Q8 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Clec4eQ9R0Q8 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Clec4eQ9R0Q8 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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