Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0Q3

Tmed2, Transmembrane emp24 domain-containing protein 2, mousemouse

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Length 201 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed2Q9R0Q3 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmed2Q9R0Q3 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmed2Q9R0Q3 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmed2Q9R0Q3 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmed2Q9R0Q3 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmed2Q9R0Q3 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmed2Q9R0Q3 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmed2Q9R0Q3 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmed2Q9R0Q3 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmed2Q9R0Q3 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmed2Q9R0Q3 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmed2Q9R0Q3 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmed2Q9R0Q3 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmed2Q9R0Q3 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmed2Q9R0Q3 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmed2Q9R0Q3 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmed2Q9R0Q3 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmed2Q9R0Q3 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmed2Q9R0Q3 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmed2Q9R0Q3 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmed2Q9R0Q3 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmed2Q9R0Q3 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmed2Q9R0Q3 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmed2Q9R0Q3 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmed2Q9R0Q3 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmed2Q9R0Q3 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmed2Q9R0Q3 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmed2Q9R0Q3 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmed2Q9R0Q3 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmed2Q9R0Q3 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmed2Q9R0Q3 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmed2Q9R0Q3 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmed2Q9R0Q3 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmed2Q9R0Q3 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmed2Q9R0Q3 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmed2Q9R0Q3 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmed2Q9R0Q3 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmed2Q9R0Q3 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmed2Q9R0Q3 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmed2Q9R0Q3 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmed2Q9R0Q3 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmed2Q9R0Q3 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmed2Q9R0Q3 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmed2Q9R0Q3 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmed2Q9R0Q3 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmed2Q9R0Q3 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmed2Q9R0Q3 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmed2Q9R0Q3 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmed2Q9R0Q3 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmed2Q9R0Q3 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmed2Q9R0Q3 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmed2Q9R0Q3 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmed2Q9R0Q3 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmed2Q9R0Q3 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmed2Q9R0Q3 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmed2Q9R0Q3 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmed2Q9R0Q3 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmed2Q9R0Q3 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmed2Q9R0Q3 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmed2Q9R0Q3 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmed2Q9R0Q3 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmed2Q9R0Q3 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Tmed2Q9R0Q3 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmed2Q9R0Q3 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmed2Q9R0Q3 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmed2Q9R0Q3 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmed2Q9R0Q3 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmed2Q9R0Q3 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmed2Q9R0Q3 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmed2Q9R0Q3 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmed2Q9R0Q3 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmed2Q9R0Q3 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmed2Q9R0Q3 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmed2Q9R0Q3 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmed2Q9R0Q3 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmed2Q9R0Q3 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmed2Q9R0Q3 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmed2Q9R0Q3 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmed2Q9R0Q3 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmed2Q9R0Q3 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmed2Q9R0Q3 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmed2Q9R0Q3 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmed2Q9R0Q3 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmed2Q9R0Q3 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmed2Q9R0Q3 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmed2Q9R0Q3 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmed2Q9R0Q3 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmed2Q9R0Q3 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmed2Q9R0Q3 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmed2Q9R0Q3 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmed2Q9R0Q3 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmed2Q9R0Q3 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmed2Q9R0Q3 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmed2Q9R0Q3 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmed2Q9R0Q3 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmed2Q9R0Q3 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmed2Q9R0Q3 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmed2Q9R0Q3 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmed2Q9R0Q3 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms