Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0E2

Plod1, Procollagen-lysine,2-oxoglutarate 5-dioxygenase 1, mousemouse

Predictions only

Length 728 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Plod1Q9R0E2 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Plod1Q9R0E2 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Plod1Q9R0E2 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Plod1Q9R0E2 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Plod1Q9R0E2 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Plod1Q9R0E2 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Plod1Q9R0E2 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Plod1Q9R0E2 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Plod1Q9R0E2 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Plod1Q9R0E2 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Plod1Q9R0E2 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Plod1Q9R0E2 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Plod1Q9R0E2 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Plod1Q9R0E2 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Plod1Q9R0E2 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Plod1Q9R0E2 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Plod1Q9R0E2 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Plod1Q9R0E2 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Plod1Q9R0E2 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Plod1Q9R0E2 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Plod1Q9R0E2 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Plod1Q9R0E2 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Plod1Q9R0E2 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Plod1Q9R0E2 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Plod1Q9R0E2 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Plod1Q9R0E2 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Plod1Q9R0E2 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Plod1Q9R0E2 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Plod1Q9R0E2 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Plod1Q9R0E2 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Plod1Q9R0E2 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Plod1Q9R0E2 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Plod1Q9R0E2 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Plod1Q9R0E2 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Plod1Q9R0E2 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Plod1Q9R0E2 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Plod1Q9R0E2 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Plod1Q9R0E2 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Plod1Q9R0E2 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Plod1Q9R0E2 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Plod1Q9R0E2 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Plod1Q9R0E2 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Plod1Q9R0E2 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Plod1Q9R0E2 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Plod1Q9R0E2 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Plod1Q9R0E2 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Plod1Q9R0E2 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Plod1Q9R0E2 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Plod1Q9R0E2 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Plod1Q9R0E2 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Plod1Q9R0E2 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Plod1Q9R0E2 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Plod1Q9R0E2 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Plod1Q9R0E2 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Plod1Q9R0E2 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Plod1Q9R0E2 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Plod1Q9R0E2 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Plod1Q9R0E2 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Plod1Q9R0E2 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Plod1Q9R0E2 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Plod1Q9R0E2 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Plod1Q9R0E2 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Plod1Q9R0E2 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Plod1Q9R0E2 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Plod1Q9R0E2 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Plod1Q9R0E2 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Plod1Q9R0E2 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Plod1Q9R0E2 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Plod1Q9R0E2 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Plod1Q9R0E2 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Plod1Q9R0E2 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Plod1Q9R0E2 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Plod1Q9R0E2 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Plod1Q9R0E2 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Plod1Q9R0E2 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Plod1Q9R0E2 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Plod1Q9R0E2 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Plod1Q9R0E2 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Plod1Q9R0E2 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Plod1Q9R0E2 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Plod1Q9R0E2 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Plod1Q9R0E2 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Plod1Q9R0E2 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Plod1Q9R0E2 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Plod1Q9R0E2 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Plod1Q9R0E2 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Plod1Q9R0E2 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Plod1Q9R0E2 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Plod1Q9R0E2 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Plod1Q9R0E2 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Plod1Q9R0E2 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Plod1Q9R0E2 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Plod1Q9R0E2 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Plod1Q9R0E2 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Plod1Q9R0E2 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Plod1Q9R0E2 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Plod1Q9R0E2 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Plod1Q9R0E2 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Plod1Q9R0E2 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Plod1Q9R0E2 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.1 ms