Protein–RNA interactions for Protein: Q9R049

Amfr, E3 ubiquitin-protein ligase AMFR, mousemouse

Predictions only

Length 643 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AmfrQ9R049 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
AmfrQ9R049 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
AmfrQ9R049 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
AmfrQ9R049 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
AmfrQ9R049 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
AmfrQ9R049 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
AmfrQ9R049 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
AmfrQ9R049 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
AmfrQ9R049 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
AmfrQ9R049 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
AmfrQ9R049 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
AmfrQ9R049 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
AmfrQ9R049 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
AmfrQ9R049 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
AmfrQ9R049 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
AmfrQ9R049 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
AmfrQ9R049 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
AmfrQ9R049 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
AmfrQ9R049 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
AmfrQ9R049 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
AmfrQ9R049 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
AmfrQ9R049 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
AmfrQ9R049 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
AmfrQ9R049 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
AmfrQ9R049 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
AmfrQ9R049 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
AmfrQ9R049 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
AmfrQ9R049 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
AmfrQ9R049 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
AmfrQ9R049 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
AmfrQ9R049 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
AmfrQ9R049 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
AmfrQ9R049 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
AmfrQ9R049 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
AmfrQ9R049 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
AmfrQ9R049 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
AmfrQ9R049 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
AmfrQ9R049 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
AmfrQ9R049 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
AmfrQ9R049 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
AmfrQ9R049 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
AmfrQ9R049 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
AmfrQ9R049 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
AmfrQ9R049 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
AmfrQ9R049 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
AmfrQ9R049 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
AmfrQ9R049 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
AmfrQ9R049 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
AmfrQ9R049 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
AmfrQ9R049 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
AmfrQ9R049 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
AmfrQ9R049 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
AmfrQ9R049 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
AmfrQ9R049 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
AmfrQ9R049 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
AmfrQ9R049 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
AmfrQ9R049 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
AmfrQ9R049 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
AmfrQ9R049 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
AmfrQ9R049 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
AmfrQ9R049 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
AmfrQ9R049 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
AmfrQ9R049 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
AmfrQ9R049 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
AmfrQ9R049 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
AmfrQ9R049 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
AmfrQ9R049 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
AmfrQ9R049 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
AmfrQ9R049 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
AmfrQ9R049 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
AmfrQ9R049 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
AmfrQ9R049 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
AmfrQ9R049 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
AmfrQ9R049 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
AmfrQ9R049 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
AmfrQ9R049 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
AmfrQ9R049 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
AmfrQ9R049 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
AmfrQ9R049 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
AmfrQ9R049 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
AmfrQ9R049 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
AmfrQ9R049 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
AmfrQ9R049 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
AmfrQ9R049 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
AmfrQ9R049 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
AmfrQ9R049 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
AmfrQ9R049 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
AmfrQ9R049 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
AmfrQ9R049 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
AmfrQ9R049 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
AmfrQ9R049 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
AmfrQ9R049 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
AmfrQ9R049 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
AmfrQ9R049 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
AmfrQ9R049 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
AmfrQ9R049 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
AmfrQ9R049 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
AmfrQ9R049 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
AmfrQ9R049 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
AmfrQ9R049 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.5 ms