Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZS0

Col4a3, Collagen alpha-3(IV) chain, mousemouse

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Length 1,669 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a3Q9QZS0 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Col4a3Q9QZS0 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Col4a3Q9QZS0 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Col4a3Q9QZS0 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Col4a3Q9QZS0 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Col4a3Q9QZS0 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Col4a3Q9QZS0 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Col4a3Q9QZS0 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Col4a3Q9QZS0 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Col4a3Q9QZS0 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Col4a3Q9QZS0 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Col4a3Q9QZS0 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Col4a3Q9QZS0 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Col4a3Q9QZS0 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Col4a3Q9QZS0 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Col4a3Q9QZS0 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Col4a3Q9QZS0 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Col4a3Q9QZS0 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Col4a3Q9QZS0 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Col4a3Q9QZS0 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Col4a3Q9QZS0 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Col4a3Q9QZS0 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Col4a3Q9QZS0 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Col4a3Q9QZS0 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Col4a3Q9QZS0 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Col4a3Q9QZS0 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Col4a3Q9QZS0 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Col4a3Q9QZS0 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Col4a3Q9QZS0 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Col4a3Q9QZS0 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Col4a3Q9QZS0 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Col4a3Q9QZS0 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Col4a3Q9QZS0 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Col4a3Q9QZS0 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Col4a3Q9QZS0 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Col4a3Q9QZS0 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Col4a3Q9QZS0 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Col4a3Q9QZS0 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Col4a3Q9QZS0 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Col4a3Q9QZS0 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Col4a3Q9QZS0 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Col4a3Q9QZS0 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Col4a3Q9QZS0 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Col4a3Q9QZS0 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Col4a3Q9QZS0 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Col4a3Q9QZS0 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Col4a3Q9QZS0 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Col4a3Q9QZS0 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Col4a3Q9QZS0 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Col4a3Q9QZS0 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Col4a3Q9QZS0 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Col4a3Q9QZS0 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Col4a3Q9QZS0 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Col4a3Q9QZS0 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Col4a3Q9QZS0 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Col4a3Q9QZS0 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Col4a3Q9QZS0 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Col4a3Q9QZS0 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Col4a3Q9QZS0 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Col4a3Q9QZS0 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Col4a3Q9QZS0 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Col4a3Q9QZS0 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Col4a3Q9QZS0 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Col4a3Q9QZS0 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Col4a3Q9QZS0 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Col4a3Q9QZS0 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Col4a3Q9QZS0 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Col4a3Q9QZS0 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Col4a3Q9QZS0 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Col4a3Q9QZS0 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Col4a3Q9QZS0 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Col4a3Q9QZS0 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Col4a3Q9QZS0 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Col4a3Q9QZS0 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Col4a3Q9QZS0 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Col4a3Q9QZS0 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Col4a3Q9QZS0 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Col4a3Q9QZS0 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Col4a3Q9QZS0 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Col4a3Q9QZS0 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Col4a3Q9QZS0 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Col4a3Q9QZS0 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Col4a3Q9QZS0 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Col4a3Q9QZS0 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Col4a3Q9QZS0 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Col4a3Q9QZS0 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Col4a3Q9QZS0 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Col4a3Q9QZS0 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Col4a3Q9QZS0 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Col4a3Q9QZS0 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Col4a3Q9QZS0 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Col4a3Q9QZS0 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Col4a3Q9QZS0 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Col4a3Q9QZS0 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Col4a3Q9QZS0 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Col4a3Q9QZS0 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Col4a3Q9QZS0 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Col4a3Q9QZS0 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Col4a3Q9QZS0 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Col4a3Q9QZS0 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
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