Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ09

Phtf1, Putative homeodomain transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 761 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phtf1Q9QZ09 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Phtf1Q9QZ09 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Phtf1Q9QZ09 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Phtf1Q9QZ09 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Phtf1Q9QZ09 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Phtf1Q9QZ09 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Phtf1Q9QZ09 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Phtf1Q9QZ09 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Phtf1Q9QZ09 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Phtf1Q9QZ09 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Phtf1Q9QZ09 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Phtf1Q9QZ09 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Phtf1Q9QZ09 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Phtf1Q9QZ09 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Phtf1Q9QZ09 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Phtf1Q9QZ09 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Phtf1Q9QZ09 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Phtf1Q9QZ09 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Phtf1Q9QZ09 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Phtf1Q9QZ09 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Phtf1Q9QZ09 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Phtf1Q9QZ09 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Phtf1Q9QZ09 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Phtf1Q9QZ09 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Phtf1Q9QZ09 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Phtf1Q9QZ09 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Phtf1Q9QZ09 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Phtf1Q9QZ09 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Phtf1Q9QZ09 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Phtf1Q9QZ09 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Phtf1Q9QZ09 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Phtf1Q9QZ09 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Phtf1Q9QZ09 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Phtf1Q9QZ09 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Phtf1Q9QZ09 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Phtf1Q9QZ09 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Phtf1Q9QZ09 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Phtf1Q9QZ09 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Phtf1Q9QZ09 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Phtf1Q9QZ09 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Phtf1Q9QZ09 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Phtf1Q9QZ09 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Phtf1Q9QZ09 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Phtf1Q9QZ09 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Phtf1Q9QZ09 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Phtf1Q9QZ09 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Phtf1Q9QZ09 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Phtf1Q9QZ09 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Phtf1Q9QZ09 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Phtf1Q9QZ09 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Phtf1Q9QZ09 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Phtf1Q9QZ09 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Phtf1Q9QZ09 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Phtf1Q9QZ09 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Phtf1Q9QZ09 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Phtf1Q9QZ09 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Phtf1Q9QZ09 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Phtf1Q9QZ09 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Phtf1Q9QZ09 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Phtf1Q9QZ09 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Phtf1Q9QZ09 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Phtf1Q9QZ09 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Phtf1Q9QZ09 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Phtf1Q9QZ09 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Phtf1Q9QZ09 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Phtf1Q9QZ09 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Phtf1Q9QZ09 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Phtf1Q9QZ09 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Phtf1Q9QZ09 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Phtf1Q9QZ09 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Phtf1Q9QZ09 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Phtf1Q9QZ09 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Phtf1Q9QZ09 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Phtf1Q9QZ09 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Phtf1Q9QZ09 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Phtf1Q9QZ09 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Phtf1Q9QZ09 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Phtf1Q9QZ09 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Phtf1Q9QZ09 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Phtf1Q9QZ09 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Phtf1Q9QZ09 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Phtf1Q9QZ09 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Phtf1Q9QZ09 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Phtf1Q9QZ09 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Phtf1Q9QZ09 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Phtf1Q9QZ09 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Phtf1Q9QZ09 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Phtf1Q9QZ09 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Phtf1Q9QZ09 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Phtf1Q9QZ09 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Phtf1Q9QZ09 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Phtf1Q9QZ09 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Phtf1Q9QZ09 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Phtf1Q9QZ09 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Phtf1Q9QZ09 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Phtf1Q9QZ09 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Phtf1Q9QZ09 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Phtf1Q9QZ09 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Phtf1Q9QZ09 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Phtf1Q9QZ09 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.8 ms