Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXZ9

Opn4, Melanopsin, mousemouse

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Length 521 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Opn4Q9QXZ9 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC13.77□□□□□ -0.21
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Opn4Q9QXZ9 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Opn4Q9QXZ9 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Opn4Q9QXZ9 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
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Opn4Q9QXZ9 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Opn4Q9QXZ9 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
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Opn4Q9QXZ9 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Opn4Q9QXZ9 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Opn4Q9QXZ9 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Opn4Q9QXZ9 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Opn4Q9QXZ9 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Opn4Q9QXZ9 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Opn4Q9QXZ9 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Opn4Q9QXZ9 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Opn4Q9QXZ9 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Opn4Q9QXZ9 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Opn4Q9QXZ9 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Opn4Q9QXZ9 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Opn4Q9QXZ9 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Opn4Q9QXZ9 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Opn4Q9QXZ9 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Opn4Q9QXZ9 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Opn4Q9QXZ9 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.8 ms