Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXK7

Cpsf3, Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 684 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpsf3Q9QXK7 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cpsf3Q9QXK7 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cpsf3Q9QXK7 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cpsf3Q9QXK7 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Cpsf3Q9QXK7 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cpsf3Q9QXK7 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Cpsf3Q9QXK7 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Cpsf3Q9QXK7 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cpsf3Q9QXK7 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cpsf3Q9QXK7 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cpsf3Q9QXK7 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cpsf3Q9QXK7 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Cpsf3Q9QXK7 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cpsf3Q9QXK7 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cpsf3Q9QXK7 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cpsf3Q9QXK7 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cpsf3Q9QXK7 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cpsf3Q9QXK7 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cpsf3Q9QXK7 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cpsf3Q9QXK7 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cpsf3Q9QXK7 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cpsf3Q9QXK7 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cpsf3Q9QXK7 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cpsf3Q9QXK7 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cpsf3Q9QXK7 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cpsf3Q9QXK7 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cpsf3Q9QXK7 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cpsf3Q9QXK7 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cpsf3Q9QXK7 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cpsf3Q9QXK7 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cpsf3Q9QXK7 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cpsf3Q9QXK7 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cpsf3Q9QXK7 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cpsf3Q9QXK7 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cpsf3Q9QXK7 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cpsf3Q9QXK7 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cpsf3Q9QXK7 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cpsf3Q9QXK7 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Cpsf3Q9QXK7 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cpsf3Q9QXK7 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cpsf3Q9QXK7 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cpsf3Q9QXK7 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cpsf3Q9QXK7 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Cpsf3Q9QXK7 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cpsf3Q9QXK7 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cpsf3Q9QXK7 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cpsf3Q9QXK7 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cpsf3Q9QXK7 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cpsf3Q9QXK7 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Cpsf3Q9QXK7 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cpsf3Q9QXK7 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cpsf3Q9QXK7 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Cpsf3Q9QXK7 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cpsf3Q9QXK7 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cpsf3Q9QXK7 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cpsf3Q9QXK7 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cpsf3Q9QXK7 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cpsf3Q9QXK7 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cpsf3Q9QXK7 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cpsf3Q9QXK7 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cpsf3Q9QXK7 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cpsf3Q9QXK7 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cpsf3Q9QXK7 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cpsf3Q9QXK7 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cpsf3Q9QXK7 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cpsf3Q9QXK7 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cpsf3Q9QXK7 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cpsf3Q9QXK7 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cpsf3Q9QXK7 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cpsf3Q9QXK7 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Cpsf3Q9QXK7 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cpsf3Q9QXK7 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Cpsf3Q9QXK7 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Cpsf3Q9QXK7 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cpsf3Q9QXK7 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cpsf3Q9QXK7 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cpsf3Q9QXK7 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cpsf3Q9QXK7 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cpsf3Q9QXK7 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cpsf3Q9QXK7 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cpsf3Q9QXK7 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cpsf3Q9QXK7 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cpsf3Q9QXK7 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cpsf3Q9QXK7 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cpsf3Q9QXK7 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cpsf3Q9QXK7 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cpsf3Q9QXK7 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cpsf3Q9QXK7 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cpsf3Q9QXK7 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cpsf3Q9QXK7 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cpsf3Q9QXK7 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cpsf3Q9QXK7 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cpsf3Q9QXK7 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cpsf3Q9QXK7 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cpsf3Q9QXK7 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cpsf3Q9QXK7 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cpsf3Q9QXK7 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cpsf3Q9QXK7 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cpsf3Q9QXK7 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cpsf3Q9QXK7 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms