Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXD8

Limd1, LIM domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 668 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Limd1Q9QXD8 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Limd1Q9QXD8 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Limd1Q9QXD8 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Limd1Q9QXD8 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Limd1Q9QXD8 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Limd1Q9QXD8 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Limd1Q9QXD8 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Limd1Q9QXD8 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Limd1Q9QXD8 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Limd1Q9QXD8 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Limd1Q9QXD8 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Limd1Q9QXD8 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Limd1Q9QXD8 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Limd1Q9QXD8 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Limd1Q9QXD8 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Limd1Q9QXD8 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Limd1Q9QXD8 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Limd1Q9QXD8 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Limd1Q9QXD8 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Limd1Q9QXD8 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Limd1Q9QXD8 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Limd1Q9QXD8 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Limd1Q9QXD8 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Limd1Q9QXD8 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Limd1Q9QXD8 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Limd1Q9QXD8 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Limd1Q9QXD8 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Limd1Q9QXD8 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Limd1Q9QXD8 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Limd1Q9QXD8 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Limd1Q9QXD8 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Limd1Q9QXD8 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Limd1Q9QXD8 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Limd1Q9QXD8 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Limd1Q9QXD8 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Limd1Q9QXD8 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Limd1Q9QXD8 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Limd1Q9QXD8 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Limd1Q9QXD8 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Limd1Q9QXD8 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Limd1Q9QXD8 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Limd1Q9QXD8 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Limd1Q9QXD8 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Limd1Q9QXD8 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Limd1Q9QXD8 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Limd1Q9QXD8 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Limd1Q9QXD8 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Limd1Q9QXD8 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Limd1Q9QXD8 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Limd1Q9QXD8 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Limd1Q9QXD8 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Limd1Q9QXD8 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Limd1Q9QXD8 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Limd1Q9QXD8 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Limd1Q9QXD8 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Limd1Q9QXD8 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Limd1Q9QXD8 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Limd1Q9QXD8 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Limd1Q9QXD8 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Limd1Q9QXD8 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Limd1Q9QXD8 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Limd1Q9QXD8 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Limd1Q9QXD8 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Limd1Q9QXD8 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Limd1Q9QXD8 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Limd1Q9QXD8 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Limd1Q9QXD8 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Limd1Q9QXD8 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Limd1Q9QXD8 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Limd1Q9QXD8 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Limd1Q9QXD8 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Limd1Q9QXD8 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Limd1Q9QXD8 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Limd1Q9QXD8 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Limd1Q9QXD8 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Limd1Q9QXD8 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Limd1Q9QXD8 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Limd1Q9QXD8 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Limd1Q9QXD8 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Limd1Q9QXD8 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Limd1Q9QXD8 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Limd1Q9QXD8 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Limd1Q9QXD8 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Limd1Q9QXD8 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Limd1Q9QXD8 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Limd1Q9QXD8 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Limd1Q9QXD8 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Limd1Q9QXD8 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Limd1Q9QXD8 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Limd1Q9QXD8 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Limd1Q9QXD8 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Limd1Q9QXD8 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Limd1Q9QXD8 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Limd1Q9QXD8 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Limd1Q9QXD8 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Limd1Q9QXD8 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Limd1Q9QXD8 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Limd1Q9QXD8 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Limd1Q9QXD8 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Limd1Q9QXD8 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.6 ms