Protein–RNA interactions for Protein: Q9QWW1

Homer2, Homer protein homolog 2, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Homer2Q9QWW1 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Homer2Q9QWW1 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Homer2Q9QWW1 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Homer2Q9QWW1 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Homer2Q9QWW1 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Homer2Q9QWW1 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Homer2Q9QWW1 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Homer2Q9QWW1 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Homer2Q9QWW1 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Homer2Q9QWW1 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Homer2Q9QWW1 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Homer2Q9QWW1 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Homer2Q9QWW1 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Homer2Q9QWW1 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Homer2Q9QWW1 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Homer2Q9QWW1 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Homer2Q9QWW1 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Homer2Q9QWW1 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Homer2Q9QWW1 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Homer2Q9QWW1 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Homer2Q9QWW1 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Homer2Q9QWW1 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Homer2Q9QWW1 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Homer2Q9QWW1 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Homer2Q9QWW1 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Homer2Q9QWW1 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Homer2Q9QWW1 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Homer2Q9QWW1 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Homer2Q9QWW1 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Homer2Q9QWW1 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Homer2Q9QWW1 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Homer2Q9QWW1 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Homer2Q9QWW1 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Homer2Q9QWW1 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Homer2Q9QWW1 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Homer2Q9QWW1 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Homer2Q9QWW1 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Homer2Q9QWW1 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Homer2Q9QWW1 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Homer2Q9QWW1 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Homer2Q9QWW1 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Homer2Q9QWW1 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Homer2Q9QWW1 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Homer2Q9QWW1 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Homer2Q9QWW1 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Homer2Q9QWW1 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Homer2Q9QWW1 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Homer2Q9QWW1 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Homer2Q9QWW1 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Homer2Q9QWW1 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Homer2Q9QWW1 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Homer2Q9QWW1 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Homer2Q9QWW1 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Homer2Q9QWW1 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Homer2Q9QWW1 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Homer2Q9QWW1 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Homer2Q9QWW1 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Homer2Q9QWW1 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Homer2Q9QWW1 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Homer2Q9QWW1 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Homer2Q9QWW1 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Homer2Q9QWW1 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Homer2Q9QWW1 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Homer2Q9QWW1 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Homer2Q9QWW1 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Homer2Q9QWW1 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Homer2Q9QWW1 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Homer2Q9QWW1 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Homer2Q9QWW1 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Homer2Q9QWW1 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Homer2Q9QWW1 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Homer2Q9QWW1 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Homer2Q9QWW1 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Homer2Q9QWW1 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Homer2Q9QWW1 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Homer2Q9QWW1 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Homer2Q9QWW1 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Homer2Q9QWW1 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Homer2Q9QWW1 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Homer2Q9QWW1 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Homer2Q9QWW1 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Homer2Q9QWW1 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Homer2Q9QWW1 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Homer2Q9QWW1 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Homer2Q9QWW1 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Homer2Q9QWW1 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Homer2Q9QWW1 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Homer2Q9QWW1 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Homer2Q9QWW1 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Homer2Q9QWW1 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Homer2Q9QWW1 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Homer2Q9QWW1 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Homer2Q9QWW1 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Homer2Q9QWW1 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Homer2Q9QWW1 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Homer2Q9QWW1 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Homer2Q9QWW1 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Homer2Q9QWW1 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Homer2Q9QWW1 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Homer2Q9QWW1 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.6 ms