Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM96

Cdc42ep4, Cdc42 effector protein 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdc42ep4Q9JM96 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cdc42ep4Q9JM96 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cdc42ep4Q9JM96 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cdc42ep4Q9JM96 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cdc42ep4Q9JM96 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cdc42ep4Q9JM96 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cdc42ep4Q9JM96 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Cdc42ep4Q9JM96 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cdc42ep4Q9JM96 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cdc42ep4Q9JM96 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cdc42ep4Q9JM96 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cdc42ep4Q9JM96 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Cdc42ep4Q9JM96 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Cdc42ep4Q9JM96 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cdc42ep4Q9JM96 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cdc42ep4Q9JM96 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cdc42ep4Q9JM96 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cdc42ep4Q9JM96 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cdc42ep4Q9JM96 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cdc42ep4Q9JM96 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cdc42ep4Q9JM96 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cdc42ep4Q9JM96 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cdc42ep4Q9JM96 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cdc42ep4Q9JM96 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cdc42ep4Q9JM96 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cdc42ep4Q9JM96 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cdc42ep4Q9JM96 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cdc42ep4Q9JM96 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cdc42ep4Q9JM96 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cdc42ep4Q9JM96 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cdc42ep4Q9JM96 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cdc42ep4Q9JM96 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cdc42ep4Q9JM96 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cdc42ep4Q9JM96 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cdc42ep4Q9JM96 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cdc42ep4Q9JM96 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cdc42ep4Q9JM96 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cdc42ep4Q9JM96 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cdc42ep4Q9JM96 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Cdc42ep4Q9JM96 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cdc42ep4Q9JM96 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Cdc42ep4Q9JM96 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Cdc42ep4Q9JM96 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cdc42ep4Q9JM96 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Cdc42ep4Q9JM96 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cdc42ep4Q9JM96 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cdc42ep4Q9JM96 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cdc42ep4Q9JM96 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cdc42ep4Q9JM96 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cdc42ep4Q9JM96 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cdc42ep4Q9JM96 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cdc42ep4Q9JM96 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cdc42ep4Q9JM96 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cdc42ep4Q9JM96 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cdc42ep4Q9JM96 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cdc42ep4Q9JM96 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cdc42ep4Q9JM96 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cdc42ep4Q9JM96 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cdc42ep4Q9JM96 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cdc42ep4Q9JM96 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cdc42ep4Q9JM96 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cdc42ep4Q9JM96 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cdc42ep4Q9JM96 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cdc42ep4Q9JM96 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cdc42ep4Q9JM96 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cdc42ep4Q9JM96 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cdc42ep4Q9JM96 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cdc42ep4Q9JM96 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cdc42ep4Q9JM96 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cdc42ep4Q9JM96 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cdc42ep4Q9JM96 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cdc42ep4Q9JM96 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cdc42ep4Q9JM96 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cdc42ep4Q9JM96 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Cdc42ep4Q9JM96 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cdc42ep4Q9JM96 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cdc42ep4Q9JM96 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cdc42ep4Q9JM96 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cdc42ep4Q9JM96 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cdc42ep4Q9JM96 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cdc42ep4Q9JM96 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cdc42ep4Q9JM96 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cdc42ep4Q9JM96 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cdc42ep4Q9JM96 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cdc42ep4Q9JM96 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cdc42ep4Q9JM96 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cdc42ep4Q9JM96 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cdc42ep4Q9JM96 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cdc42ep4Q9JM96 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cdc42ep4Q9JM96 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cdc42ep4Q9JM96 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cdc42ep4Q9JM96 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cdc42ep4Q9JM96 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cdc42ep4Q9JM96 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cdc42ep4Q9JM96 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cdc42ep4Q9JM96 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cdc42ep4Q9JM96 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cdc42ep4Q9JM96 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cdc42ep4Q9JM96 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cdc42ep4Q9JM96 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.3 ms